RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.72■□□□□ 0.43
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NISCH-205ENST00000467594 PBX2P40425 430 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-205ENST00000467594 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-205ENST00000467594 Q6ZUG5 572 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-205ENST00000467594 LRRC8DQ7L1W4 858 aa17.71■□□□□ 0.43
NISCH-205ENST00000467594 GPR20Q99678 358 aa17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-205ENST00000467594 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
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NISCH-205ENST00000467594 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.69■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 SMCO2A6NFE2 343 aa17.69■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.69■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.68■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 AP3B2Q13367 1082 aa17.68■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 MCTP2Q6DN12 878 aa17.68■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.68■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.67■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.67■□□□□ 0.42
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NISCH-205ENST00000467594 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 C6orf50Q9HD87 102 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 ERAP1Q9NZ08 941 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 NRCAMQ92823 1304 aa17.65■□□□□ 0.42
NISCH-205ENST00000467594 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP17.64■□□□□ 0.41
NISCH-205ENST00000467594 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa17.64■□□□□ 0.41
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