RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	RRAGC	Q9HB90	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	IFNK	Q9P0W0	207 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	OSBP	P22059	807 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PRCP	P42785	496 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	STX17	P56962	302 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	HERVK_113	P62684	666 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	FANCC	Q00597	558 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP4A11	Q02928	519 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SNAPC2	Q13487	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	STIM1	Q13586	685 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MOGS	Q13724	837 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DYM	Q7RTS9	669 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX12P	Q92771	950 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MED15	Q96RN5	788 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PFAS	O15067	1338 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PEX10	O60683	326 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CNMD	O75829	334 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINC1	P01008	464 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PPP1R2	P41236	205 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	FKBP1B	P68106	108 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	GPBP1	Q86WP2	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ADSSL1	Q8N142	457 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NEK9	Q8TD19	979 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	UTRN	P46939	3433 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMA7	O14818	248 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	TPM3	P06753	285 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NR3C2	P08235	984 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	FCER1A	P12319	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	IDE	P14735	1019 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF18	P17022	549 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CYP11B2	P19099	503 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC12A3	P55017	1021 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	EPHA7	Q15375	998 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NLRX1	Q86UT6	975 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	RGL1	Q9NZL6	768 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DNM3	Q9UQ16	869 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MYH11	P35749	1972 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	EYA4	O95677	639 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MUT	P22033	750 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	COPB2	P35606	906 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	UBASH3A	P57075	661 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	PSMC6	P62333	389 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	STK4	Q13043	487 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	COASY	Q13057	564 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	GPRASP2	Q96D09	838 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HDLBP-231	ENST00000467435	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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