RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464936.5

CEP170-209, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 5

Gene CEP170, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-209	ENST00000464936	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ERVK-24	P63145	666 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PRKG1	Q13976	671 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PKN1	Q16512	942 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	TTC28	Q96AY4	2481 aa		5.79	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	LAMB2	P55268	1798 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936		H0YGN5	161 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PAGE1	O75459	146 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ANXA1	P04083	346 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	FGR	P09769	529 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	JAG1	P78504	1218 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ARHGEF6	Q15052	776 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	COPS6	Q7L5N1	327 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	KSR1	Q8IVT5	923 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	RHOV	Q96L33	236 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	SPON2	Q9BUD6	331 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		5.78	□□□□□ -1.48
CEP170-209	ENST00000464936	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CENPF	P49454	3210 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936		F6X3S4	739 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	INHBE	P58166	350 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ZP2	Q05996	745 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	PROSER3	Q2NL68	480 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	FAM89A	Q96GI7	184 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	HTT	P42858	3142 aa		5.77	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ENC1	O14682	589 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CELA3A	P09093	270 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	LIG3	P49916	1009 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	RBL2	Q08999	1139 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	LRRC14	Q15048	493 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ASB11	Q8WXH4	323 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	DPF3	Q92784	378 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		5.76	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	XDH	P47989	1333 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SASH1	O94885	1247 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	BMP6	P22004	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	GART	P22102	1010 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SP3	Q02447	781 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	LMNB2	Q03252	620 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CRHR2	Q13324	411 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	NFE2L2	Q16236	605 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CEP170-209	ENST00000464936	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		5.75	□□□□□ -1.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms