RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464518.1

SLC13A3-208, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SLC13A3, Length 792 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-208ENST00000464518 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 NLRC5Q86WI3 1866 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 TGFB3P10600 412 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 IRS1P35568 1242 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CHST3Q7LGC8 479 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 DGKHQ86XP1 1220 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 WNT8BQ93098 351 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CLDND1Q9NY35 253 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ST18O60284 1047 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF286BP0CG31 522 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 THPOP40225 353 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PTPN5P54829 565 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 VPS53Q5VIR6 699 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 RPAINQ86UA6 219 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PXMP2Q9NR77 195 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 COL20A1Q9P218 1284 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 FGAP02671 866 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 NR3C2P08235 984 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 LTBRP36941 435 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 EDAQ92838 391 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 EVI5LQ96CN4 794 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MBTPS2O43462 519 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 GNAT1P11488 350 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MX1P20591 662 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MFSD6Q6ZSS7 791 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ESR2Q92731 530 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PPP2R3CQ969Q6 453 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 SPATA33Q96N06 139 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 C16orf70Q9BSU1 422 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HSD17B4P51659 736 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 EP400NLQ6ZTU2 488 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 IQCA1Q86XH1 822 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 FIBCD1Q8N539 461 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 IL17RAQ96F46 866 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PLVAPQ9BX97 442 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 H3BRB1 525 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 EYA4O95677 639 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MMP1P03956 469 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 BMPR1AP36894 532 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 FOXK2Q01167 660 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 HIC1Q14526 733 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 FAM26DQ5JW98 314 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 RNF135Q8IUD6 432 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PNMA1Q8ND90 353 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 TBC1D5Q92609 795 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 ANKS1AQ92625 1134 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 USP26Q9BXU7 913 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC13A3-208ENST00000464518 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 STAM2O75886 525 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 RGS20O76081 388 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 GGPS1O95749 300 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 LINC00271P0C7V0 271 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 CTNNB1P35222 781 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 HYAL1Q12794 435 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 TRAF1Q13077 416 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 NAALADL2Q58DX5 795 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 C20orf194Q5TEA3 1177 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 P2RX5Q93086 422 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 AMNQ9BXJ7 453 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 CD207Q9UJ71 328 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 MYH6P13533 1939 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 FSD2A1L4K1 749 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 STXBP3O00186 592 aa14.69□□□□□ -0.06
SLC13A3-208ENST00000464518 UPP2O95045 317 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms