RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ12Q14500 433 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN21Q16825 1174 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MIIPQ5JXC2 388 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KLHL10Q6JEL2 608 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SV2BQ7L1I2 683 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 GLIS3Q8NEA6 775 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 REPS2Q8NFH8 660 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 JDP2Q8WYK2 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LPAR1Q92633 364 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf42Q96LP6 360 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B14Q9BPX1 270 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RAB34Q9BZG1 259 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SH2D4AQ9H788 454 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 VEZTQ9HBM0 779 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FBXO28Q9NVF7 368 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 COL20A1Q9P218 1284 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MYH11P35749 1972 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EML1O00423 815 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MEIS1O00470 390 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ARHGAP6O43182 974 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MFAP3LO75121 409 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 COBLO75128 1261 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ICAM1P05362 532 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 BCRP11274 1271 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RPA1P27694 616 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HOXD13P35453 343 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 STAT3P40763 770 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ASIC1P78348 528 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 AMPD3Q01432 767 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PDE4DQ08499 809 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 COASYQ13057 564 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD2Q13200 908 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PPP2R5CQ13362 524 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 TNFAIP1Q13829 316 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 USH1GQ495M9 461 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 KRT79Q5XKE5 535 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MIGA2Q7L4E1 593 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LDHDQ86WU2 507 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DDX12PQ92771 950 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HPS3Q969F9 1004 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC51Q96ER9 411 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DNAJC7Q99615 494 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NT5C3AQ9H0P0 336 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 EXOC1Q9NV70 894 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HACL1Q9UJ83 578 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 BICDL2A1A5D9 508 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 POTECB2RU33 542 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 E9PMD0 336 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DYNC1I1O14576 645 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G4BP0C869 781 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 VCAM1P19320 739 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MUTP22033 750 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PSMC6P62333 389 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC63Q05C16 580 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 RBL2Q08999 1139 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 MEA1Q16626 185 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 PRR16Q569H4 304 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 FIGNQ5HY92 759 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRC-210ENST00000462363 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms