RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 BORAQ6PGQ7 559 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 TEPPQ6URK8 271 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 JAM3Q9BX67 310 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGGTB-204ENST00000461653 MROH6A6NGR9 719 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 KRIT1O00522 736 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PRODHO43272 600 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 LRG1P02750 347 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB33AQ14088 237 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF827Q17R98 1081 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 MARCH6O60337 910 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 FGFR1P11362 822 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF28P17035 718 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 DCAF4Q8WV16 495 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CLIC6Q96NY7 704 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 WRNIP1Q96S55 665 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ITGB3P05106 788 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 LGI4Q8N135 537 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.57□□□□□ -1.36
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RABGGTB-204ENST00000461653 GRK2P25098 689 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GRK3P35626 688 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 NTRK3Q16288 839 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 NSMFQ6X4W1 530 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 LBX2Q6XYB7 198 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 OSBP2Q969R2 916 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM209Q96SK2 561 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 JAG2Q9Y219 1238 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 INVSQ9Y283 1065 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC27A2O14975 620 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PLATP00750 562 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 KIZQ2M2Z5 673 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CROTQ9UKG9 612 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 NUB1Q9Y5A7 615 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 BLACEA4D250 179 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf118A6NHY6 69 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 OTOP3Q7RTS5 596 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
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RABGGTB-204ENST00000461653 WASF3Q9UPY6 502 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 IL13P35225 146 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR85P60893 370 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GRIN1Q05586 938 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 STYK1Q6J9G0 422 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GGNQ86UU5 652 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CKAP2LQ8IYA6 745 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PSMD1Q99460 953 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR20Q99678 358 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RBPJLQ9UBG7 517 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 GNAT1P11488 350 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 IFNL3Q8IZI9 196 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNJ15Q99712 375 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 COL6A2P12110 1019 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 TUSC3Q13454 348 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 PROSER1Q86XN7 944 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-204ENST00000461653 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.53□□□□□ -1.36
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