RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 FBLN7Q53RD9 439 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC5Q8N0Z6 440 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNB2Q92953 911 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SPEGQ15772 3267 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FRYLO94915 3013 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 MGAMO43451 1857 aa6.39□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 HLFQ16534 295 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ECM1Q16610 540 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 CITED4Q96RK1 184 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM129BQ96TA1 746 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 OTOFQ9HC10 1997 aa6.38□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FYB1O15117 783 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 CETPP11597 493 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ITIH2P19823 946 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SERPINB4P48594 390 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 RTP1P59025 263 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ARHGAP4P98171 946 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GRM2Q14416 872 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ADSSL1Q8N142 457 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GMLQ99445 158 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 EYA3Q99504 573 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 NIF3L1Q9GZT8 377 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 BPTFQ12830 3046 aa6.37□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PROB1E7EW31 1015 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 HMGCRP04035 888 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 EPHB4P54760 987 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ISL2Q96A47 359 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM84AQ96KN4 292 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 POLLQ9UGP5 575 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.36□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 MYO9BQ13459 2157 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 H0Y858 1186 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 NEFMP07197 916 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GPTP24298 496 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 LCE4AQ5TA78 99 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 TLR9Q9NR96 1032 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 FAM53CQ9NYF3 392 aa6.35□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PDHXO00330 501 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 MESP2Q0VG99 397 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 IKZF1Q13422 519 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SNAPC2Q13487 334 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 VGLL4Q14135 290 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PDZD3Q86UT5 571 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SULF2Q8IWU5 870 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 RNF214Q8ND24 703 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 ASB11Q8WXH4 323 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 MSRAQ9UJ68 235 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 CSADQ9Y600 493 aa6.34□□□□□ -1.39
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR182O15218 404 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ARNTP27540 789 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ERVK-24P63145 666 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 ZP2Q05996 745 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 GRAPQ13588 217 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNMB1Q16558 191 aa6.33□□□□□ -1.4
RABGGTB-203ENST00000459697 MLANAQ16655 118 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms