RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454001.1

RPSAP54-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP54, Length 886 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP54-201ENST00000454001 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 MICALL1Q8N3F8 863 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 FANCBQ8NB91 859 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 KCNG4Q8TDN1 519 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 CPVLQ9H3G5 476 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 CLIC4Q9Y696 253 aa9.6□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 ZEB2O60315 1214 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 PLA2G6O60733 806 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 CYP2C9P11712 490 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 MYOGP15173 224 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 NT5C2P49902 561 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TRIM29Q14134 588 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 STK38Q15208 465 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 USH1GQ495M9 461 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 HS1BP3Q53T59 392 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 RASIP1Q5U651 963 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 IQCA1Q86XH1 822 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC43A3Q8NBI5 491 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 OR6J1Q8NGC5 347 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 WDR11Q9BZH6 1224 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 VTA1Q9NP79 307 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 MSRAQ9UJ68 235 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.59□□□□□ -0.87
RPSAP54-201ENST00000454001 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ESPNB1AK53 854 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 SPTLC2O15270 562 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CABYRO75952 493 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 DDAH1O94760 285 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 DEXIO95424 95 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FGBP02675 491 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CALM1P0DP23 149 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CALM2P0DP24 149 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CALM3P0DP25 149 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PDHBP11177 359 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ME1P48163 572 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PDE4DQ08499 809 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ADGRE1Q14246 886 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 RAB30Q15771 203 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CAMK4Q16566 473 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ADALQ6DHV7 355 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 IQSEC1Q6DN90 963 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FSIP1Q8NA03 581 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 HERVK_113Q902F9 699 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 COPS5Q92905 334 aa9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 NCOR1O75376 2440 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PTPRSQ13332 1948 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 MMP1P03956 469 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 NKX3-2P78367 333 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 ZNF543Q08ER8 600 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FUT2Q10981 343 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 TROAPQ12815 778 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 TTLL4Q14679 1199 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC39A14Q15043 492 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PTPAQ15257 358 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 FAM200AQ8TCP9 573 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CLEC4DQ8WXI8 215 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 CERS4Q9HA82 394 aa9.57□□□□□ -0.88
RPSAP54-201ENST00000454001 SLC28A3Q9HAS3 691 aa9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms