RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446332.1

SOX9-AS1-207, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 443 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RTN1Q16799 776 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADCK5Q3MIX3 580 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LRRC8DQ7L1W4 858 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DEFB128Q7Z7B8 93 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SERINC5Q86VE9 423 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GPR20Q99678 358 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ALG1Q9BT22 464 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EMSYQ7Z589 1322 aa16.07■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LGALS2P05162 132 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CHMP4BP1P59074 171 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GPNMBQ14956 572 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RIC8AQ9NPQ8 531 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BRPF3Q9ULD4 1205 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TTC28Q96AY4 2481 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 VCANP13611 3396 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PTPRSQ13332 1948 aa16.06■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZBBXA8MT70 800 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KIF28PB7ZC32 967 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MCTP2Q6DN12 878 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CNKSR3Q6P9H4 555 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SKAP1Q86WV1 359 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CCDC82Q8N4S0 544 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AGXT2Q9BYV1 514 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 JADE2Q9NQC1 790 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PCDHA6Q9UN73 950 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NID2Q14112 1375 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 C17orf102A2RUQ5 167 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 DLL1O00548 723 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KCNA2P16389 499 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ITGB5P18084 799 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PSMA5P28066 241 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RPAINQ86UA6 219 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BARHL2Q9NY43 387 aa16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NRCAMQ92823 1304 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NBNO60934 754 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 EVCP57679 992 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ADAM17P78536 824 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 FGD1P98174 961 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 AP3B2Q13367 1082 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MTMR1Q13613 665 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 IKBKEQ14164 716 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZNF618Q5T7W0 954 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ERICH6BQ5W0A0 696 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WWC2Q6AWC2 1192 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HERC6Q8IVU3 1022 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa16.03■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ESYT2A0FGR8 921 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GOLGA8AA7E2F4 631 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 RSPH10BP0C881 870 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 KCNJ6P48051 423 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NAPAP54920 295 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 HIC1Q14526 733 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 MXRA8Q9BRK3 442 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SNX14Q9Y5W7 946 aa16.02■□□□□ 0.16
SOX9-AS1-207ENST00000446332 WDR81Q562E7 1941 aa16.02■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 NFASCO94856 1347 aa16.01■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa16.01■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 SMCO2A6NFE2 343 aa16.01■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 STXBP3O00186 592 aa16.01■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 ATP9AO75110 1047 aa16.01■□□□□ 0.15
SOX9-AS1-207ENST00000446332 LGR5O75473 907 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms