RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 KLF15Q9UIH9 416 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TMCC2O75069 709 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 S100A6P06703 90 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC18P0CG32 403 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM27P14373 513 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 LSP1P33241 339 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CDR2Q01850 454 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DNAJC3Q13217 504 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 KAT2BQ92831 832 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF839A8K0R7 811 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 COBLO75128 1261 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SPAG7O75391 227 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 GJB2P29033 226 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GALK1P51570 392 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RGS21Q2M5E4 152 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 BOLA3Q53S33 107 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CORO6Q6QEF8 472 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 RELL1Q8IUW5 271 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GIPC3Q8TF64 312 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PSTPIP2Q9H939 334 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CD209Q9NNX6 404 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 WDR35Q9P2L0 1181 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ASNA1O43681 348 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SGTAO43765 313 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MCF2P10911 925 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ATF6P18850 670 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM23P36406 574 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM17P78536 824 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 APPL2Q8NEU8 664 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CLSTN2Q9H4D0 955 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.03□□□□□ -1.44
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PTPRC-209ENST00000442510 SENP1Q9P0U3 644 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM2Q13029 1718 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PASKQ96RG2 1323 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GVL5 298 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf81A6NN90 581 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MFN2O95140 757 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 PENKP01210 267 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9A3P48764 834 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NUP107P57740 925 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 FANCCQ00597 558 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 GRIN1Q05586 938 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 DENND2CQ68D51 928 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 EMBQ6PCB8 327 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZUG5 572 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 HDDC2Q7Z4H3 204 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 KRT73Q86Y46 540 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CATSPER1Q8NEC5 780 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 CYTH2Q99418 400 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 NDE1Q9NXR1 346 aa6.03□□□□□ -1.44
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 UNCXA6NJT0 531 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CCDC169A6NNP5 214 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.02□□□□□ -1.45
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM25GB3EWG6 89 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ALFQ53S48 1182 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 ANO1Q5XXA6 986 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 CYFIP2Q96F07 1278 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRC-209ENST00000442510 STON1Q9Y6Q2 735 aa6.02□□□□□ -1.45
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