RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439619.6

CCDC78-204, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC78, Length 1,064 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-204ENST00000439619 NAPAP54920 295 aa21.57■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.57■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.57■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.56■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.55■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa21.54■■□□□ 1.04
CCDC78-204ENST00000439619 HERC6Q8IVU3 1022 aa21.54■■□□□ 1.04
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CCDC78-204ENST00000439619 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.5■■□□□ 1.03
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CCDC78-204ENST00000439619 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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CCDC78-204ENST00000439619 ATP9AO75110 1047 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ZNF76P36508 570 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 ARHGAP4P98171 946 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 FUT2Q10981 343 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa21.49■■□□□ 1.03
CCDC78-204ENST00000439619 AZI2Q9H6S1 392 aa21.49■■□□□ 1.03
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