RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439454.2

LINC00376-201, long intergenic non-protein coding RNA 376, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00376, Length 693 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00376-201ENST00000439454 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 DTLQ9NZJ0 730 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 SMARCA2P51531 1590 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 KLF4O43474 513 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 B4GALT3O60512 393 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 IL13P35225 146 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 ZNF827Q17R98 1081 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 SOGA3Q5TF21 947 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 LIMS2Q7Z4I7 341 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 MBD6Q96DN6 1003 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 IER2Q9BTL4 223 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PHF19Q5T6S3 580 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 C8orf49Q96NF6 230 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 GPR20Q99678 358 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 WIZO95785 1651 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 DGKIO75912 1065 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 RBM10P98175 930 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 MAP4K2Q12851 820 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 RAB33AQ14088 237 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PROSER1Q86XN7 944 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 LGI4Q8N135 537 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 LOXL4Q96JB6 756 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 EPB41L1Q9H4G0 881 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 MYOTQ9UBF9 498 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 CROTQ9UKG9 612 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 SLC27A2O14975 620 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 GRIN1Q05586 938 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 CHRNA2Q15822 529 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 USP53Q70EK8 1073 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 NBPF4Q96M43 638 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 EPN3Q9H201 632 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 SMOC1Q9H4F8 434 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00376-201ENST00000439454 PEG3Q9GZU2 1588 aa6.65□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 NESP48681 1621 aa6.65□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 LTFP02788 710 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 NTRK3Q16288 839 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 DDR2Q16832 855 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 SAMD11Q96NU1 681 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 PTPN18Q99952 460 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 PIF1Q9H611 641 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 GPR27Q9NS67 375 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 HMGXB3Q12766 1538 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 BLACEA4D250 179 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 ZNF536O15090 1300 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 COL6A1P12109 1028 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 COL6A2P12110 1019 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 ZNF20P17024 532 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 SERINC3Q13530 473 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 BORAQ6PGQ7 559 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 FAM124AQ86V42 546 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 OSBP2Q969R2 916 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CLIC6Q96NY7 704 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 ARHGEF4Q9NR80 690 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CCDC88BA6NC98 1476 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 C9orf118A6NHY6 69 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 PRODHO43272 600 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 TNFRSF1AP19438 455 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 CPZQ66K79 652 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 BORCS6Q96GS4 357 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 AGRPO00253 132 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00376-201ENST00000439454 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms