RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 KCNMA1Q12791 1236 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 MAN2A1Q16706 1144 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 GJA10Q969M2 543 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 IL17RBQ9NRM6 502 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CASZ1Q86V15 1759 aa16.97■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CACNA1SQ13698 1873 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 OPLAHO14841 1288 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 FAM107AO95990 144 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 HSD17B3P37058 310 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CDR1P51861 262 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 ANKRD2Q9GZV1 360 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 LAMB2P55268 1798 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CEP104O60308 925 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 CENPPQ6IPU0 288 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.96■□□□□ 0.31
SFRP4-201ENST00000436072 A0A087X0T9 212 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CHUKO15111 745 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FAM228BP0C875 321 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MYZAPP0CAP1 466 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NAPAP54920 295 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NELFCDQ8IXH7 590 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FAM133AQ8N9E0 248 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM260Q9NX78 707 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 M0R2N6 131 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 LCA5LO95447 670 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SFMBT2Q5VUG0 894 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SV2BQ7L1I2 683 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OSBPL7Q9BZF2 842 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TNFRSF8P28908 595 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TEX2Q8IWB9 1127 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MDM1Q8TC05 714 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NUDT12Q9BQG2 462 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MAD2L2Q9UI95 211 aa16.95■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 STXBP3O00186 592 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TRAF5O00463 557 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PJA2O43164 708 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CALML4Q96GE6 196 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GMNCA6NCL1 334 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 POTEMA6NI47 508 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 A6NNZ2 444 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MYL1P05976 194 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SMTNP53814 917 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 AMPD3Q01432 767 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RUBCNQ92622 972 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TAF4BQ92750 862 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa16.94■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 AFF2P51816 1311 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RASSF9O75901 435 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RPSAP08865 295 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MKNK2Q9HBH9 465 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SMCO2A6NFE2 343 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FGRP09769 529 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PSEN1P49768 467 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DDR1Q08345 913 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GRB10Q13322 594 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 USP38Q8NB14 1042 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TBCKQ8TEA7 893 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DPH5Q9H2P9 285 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ODF2LQ9ULJ1 636 aa16.93■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ORC4O43929 436 aa16.92■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NF2P35240 595 aa16.92■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NAB2Q15742 525 aa16.92■□□□□ 0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MEI1Q5TIA1 1274 aa16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms