RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 MYH10P35580 1976 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 EFCAB8A8MWE9 144 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 EML1O00423 815 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZNF263O14978 683 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 UBXN2AP68543 259 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 Q4G0T1 1027 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CCDC174Q6PII3 467 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM114A1Q8IWE2 563 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 UBXN4Q92575 508 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 WDR18Q9BV38 432 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 VAV3Q9UKW4 847 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa15.5■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAFGO15525 162 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PPP1R2P41236 205 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 APBA1Q02410 837 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CYP4A11Q02928 519 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.071e-7■■■□□ 18.8
RBM39-212ENST00000429968 DLGAP5Q15398 846 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MYOCDQ8IZQ8 938 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 SCFD1Q8WVM8 642 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM151AQ8WW52 585 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 GUCA1BQ9UMX6 200 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 TMX2Q9Y320 296 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 SPDYE3A6NKU9 549 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 STAT2P52630 851 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CYP27A1Q02318 531 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 KCNMA1Q12791 1236 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 TEX35Q5T0J7 233 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MOXD1Q6UVY6 613 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 KRT26Q7Z3Y9 468 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 NT5C3AQ9H0P0 336 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PGAP2Q9UHJ9 254 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.49■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 RSPH10B2B2RC85 870 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 RSPH10BP0C881 870 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZBED6P86452 979 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 LRRC63Q05C16 580 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 DGKZQ13574 1117 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MAN2A1Q16706 1144 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 NBPF9Q3BBW0 867 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 KCTD10Q9H3F6 313 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 RGL1Q9NZL6 768 aa15.48■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 EGFRP00533 1210 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CFBP00751 764 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 HOXD13P35453 343 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 PSMD2Q13200 908 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 SLFN12Q8IYM2 578 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ST7Q9NRC1 585 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FAM53CQ9NYF3 392 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ENC1O14682 589 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZBTB39O15060 712 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CIITAP33076 1130 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 AMPD2Q01433 879 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 GIT2Q14161 759 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FEZ1Q99689 392 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 REEP2Q9BRK0 252 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ZHX3Q9H4I2 956 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 CDC23Q9UJX2 597 aa15.47■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 TRAF5O00463 557 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FKBP15Q5T1M5 1219 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 BAP1Q92560 729 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 NUP58Q9BVL2 599 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 RUSC1Q9BVN2 902 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 IKZF4Q9H2S9 585 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MMRN2Q9H8L6 949 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 MYH11P35749 1972 aa15.46■□□□□ 0.07
RBM39-212ENST00000429968 A0A1W2PQJ5 194 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 CTAGE9A4FU28 777 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 PIK3CDO00329 1044 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 RPA1P27694 616 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 FIGNQ5HY92 759 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 RETREG2Q8NC44 543 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 OGFRQ9NZT2 677 aa15.46■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 LRRC53A6NM62 1247 aa15.45■□□□□ 0.06
RBM39-212ENST00000429968 NOL4O94818 638 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms