RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SP4Q02446 784 aa20.55■□□□□ 0.88
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HERC3-205ENST00000426683 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 DAGLBQ8NCG7 672 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 KAT2BQ92831 832 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 GPR20Q99678 358 aa20.55■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 GDF15Q99988 308 aa20.55■□□□□ 0.88
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HERC3-205ENST00000426683 ARP10275 920 aa20.54■□□□□ 0.88
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HERC3-205ENST00000426683 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.53■□□□□ 0.88
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HERC3-205ENST00000426683 SDF4Q9BRK5 362 aa20.52■□□□□ 0.88
HERC3-205ENST00000426683 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.52■□□□□ 0.88
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HERC3-205ENST00000426683 C7orf31Q8N865 590 aa20.5■□□□□ 0.87
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HERC3-205ENST00000426683 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
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HERC3-205ENST00000426683 EDIL3O43854 480 aa20.49■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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HERC3-205ENST00000426683 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 NOD1Q9Y239 953 aa20.48■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 CEP290O15078 2479 aa20.48■□□□□ 0.87
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HERC3-205ENST00000426683 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 KRT2P35908 639 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 PTGISQ16647 500 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 INF2Q27J81 1249 aa20.47■□□□□ 0.87
HERC3-205ENST00000426683 LENG9Q96B70 501 aa20.47■□□□□ 0.87
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