RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MREGQ8N565 214 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 NR1D1P20393 614 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PAK2Q13177 524 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT81Q8WYA0 676 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf50Q9HD87 102 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM260Q9NX78 707 aa20.2■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R37O75864 691 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 DNA2P51530 1060 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCY2DQ02846 1103 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC41Q15345 812 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIK5Q16478 980 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 UNC13DQ70J99 1090 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ESYT3A0FGR9 886 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RASA1P20936 1047 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP14Q86W24 1093 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 NOX5Q96PH1 765 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA5Q96PV4 448 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CCT8L2Q96SF2 557 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.19■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 POTEMA6NI47 508 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GNA11P29992 359 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 HGSNATQ68CP4 663 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC55Q6ZSA7 311 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRC4Q9NPP4 1024 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF14Q9UBS8 474 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TSKSQ9UJT2 592 aa20.18■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GUCY2FP51841 1108 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PDXDC1Q6P996 788 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGSQ96S52 555 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC24CP53992 1094 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SOGA3Q5TF21 947 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 VCPKMTQ9H867 229 aa20.17■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC37A4O43826 429 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CALCRLQ16602 461 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 GGA2Q9UJY4 613 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 APBA3O96018 575 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNMA1Q12791 1236 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNK18Q7Z418 384 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MTMR9Q96QG7 549 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CD248Q9HCU0 757 aa20.16■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 UFL1O94874 794 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TDP2O95551 362 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP14P50281 582 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC63Q05C16 580 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RPAINQ86UA6 219 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX12PQ92771 950 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 TLR2O60603 784 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM107AO95990 144 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SMTNP53814 917 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 WHAMMQ8TF30 809 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 STK17AQ9UEE5 414 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCB11O95342 1321 aa20.15■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 FTCDO95954 541 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC172P0C7W6 258 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 IFT88Q13099 833 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCB4Q15147 1175 aa20.14■□□□□ 0.82
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms