RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HERVK_113P62684 666 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCNA1P78396 465 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SREBF2Q12772 1141 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NR5A1Q13285 461 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DGKZQ13574 1117 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NFKBIBQ15653 356 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 INF2Q27J81 1249 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TTC38Q5R3I4 469 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TREML2Q5T2D2 321 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CST9Q5W186 159 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LBX2Q6XYB7 198 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RNF207Q6ZRF8 634 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NEK8Q86SG6 692 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM87AQ8NBN3 555 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TNFRSF25Q93038 417 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC102AQ96A19 550 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ATG4CQ96DT6 458 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HHIPL1Q96JK4 782 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 USP28Q96RU2 1077 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PAGR1Q9BTK6 254 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ANP32EQ9BTT0 268 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ANO3Q9BYT9 981 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAF1Q9H063 256 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ACAD9Q9H845 621 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HOMER2Q9NSB8 354 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RNF146Q9NTX7 359 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PCDHA6Q9UN73 950 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TLL2Q9Y6L7 1015 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UTRNP46939 3433 aa3.81□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF536O15090 1300 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 M0R2N6 131 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PDHXO00330 501 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MARCH6O60337 910 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NEMFO60524 1076 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CUTAO60888 179 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SLC25A27O95847 323 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 OR52Z1P0C646 297 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GJA5P36382 358 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF76P36508 570 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TXLNAP40222 546 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 STAT3P40763 770 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NASPP49321 788 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HSD17B4P51659 736 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 INHBEP58166 350 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UBE2HP62256 183 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GHRHRQ02643 423 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NOGQ13253 232 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GRM1Q13255 1194 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPY5RQ15761 445 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UBE2SQ16763 222 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM266Q2M3C6 531 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LETM2Q2VYF4 491 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RNFT1Q5M7Z0 435 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WDR78Q5VTH9 848 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SMYD5Q6GMV2 418 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM173BQ6P4H8 233 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MOXD1Q6UVY6 613 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NSMFQ6X4W1 530 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FCHSD1Q86WN1 690 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RIOX2Q8IUF8 465 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SHCBP1Q8NEM2 672 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHST13Q8NET6 341 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RASGRP4Q8TDF6 673 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FERMT2Q96AC1 680 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SHISA4Q96DD7 197 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 AGBL1Q96MI9 1066 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRERF1Q96PN7 1200 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.8□□□□□ -1.8
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RAB34Q9BZG1 259 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms