RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376233.7

ZNF549-202, Transcript of zinc finger protein 549, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF549, Length 4,053 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF549-202ENST00000376233 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 EPB41L5Q9HCM4 733 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.66□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 H3BQF6 201 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 PPIP5K2O43314 1243 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 FANCGO15287 622 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 GNA14O95837 355 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGAP4P98171 946 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 EXOC4Q96A65 974 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 MS4A14Q96JA4 679 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 PALMO75781 387 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 FLOT1O75955 427 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 APBA1Q02410 837 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 LLGL1Q15334 1064 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 DAAM2Q86T65 1068 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 IRF2BP1Q8IU81 584 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 IQCDQ96DY2 449 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 MED4Q9NPJ6 270 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.65□□□□□ -0.54
ZNF549-202ENST00000376233 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 EBAG9O00559 213 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 CYP2C19P33261 490 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ACTN2P35609 894 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ARHGAP25P42331 645 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 SLC30A10Q6XR72 485 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 COG1Q8WTW3 980 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 LRRC1Q9BTT6 524 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 BCS1LQ9Y276 419 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa11.65□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 F5H6K3 240 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 KLRC4O43908 158 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 FGRP09769 529 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ACTN1P12814 892 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 TNFAIP3P21580 790 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GGCXP38435 758 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 KLRC3Q07444 240 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 KCNH2Q12809 1159 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 KCNK18Q7Z418 384 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 AMIGO3Q86WK7 504 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 C4orf32Q8N8J7 132 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 LRRN2O75325 713 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GFPT2O94808 682 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 BMP3P12645 472 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 PSMD2Q13200 908 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 LRCH2Q5VUJ6 765 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GBP6Q6ZN66 633 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 MICALL1Q8N3F8 863 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DNAJC7Q99615 494 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 RGL1Q9NZL6 768 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ADAMTSL3P82987 1691 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 SPEF2Q9C093 1822 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GYS1P13807 737 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 PDE6BP35913 854 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GNGT1P63211 74 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 PAK2Q13177 524 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DNAAF5Q86Y56 855 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 NLGN1Q8N2Q7 840 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 LMBR1Q8WVP7 490 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 GOLPH3Q9H4A6 298 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 NFU1Q9UMS0 254 aa11.64□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 NDUFAB1O14561 156 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 PBX1P40424 430 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 STAT1P42224 750 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 ODR4Q5SWX8 454 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DPH5Q9H2P9 285 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 AFPP02771 609 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 SERPING1P05155 500 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 TMEM132AQ24JP5 1023 aa11.63□□□□□ -0.55
ZNF549-202ENST00000376233 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms