RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 PTGS1P23219 599 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 NEDD9Q14511 834 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC39A14Q15043 492 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 LINC00301Q8NCQ3 95 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TBC1D22BQ9NU19 505 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GAS7O60861 476 aa29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 YEATS4O95619 227 aa29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GGPS1O95749 300 aa29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 CYFIP1Q7L576 1253 aa29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 RIT2Q99578 217 aa29.95■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 NFASCO94856 1347 aa29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 PCDHA12Q9UN75 941 aa29.94■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 PSMD10O75832 226 aa29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 PRPHP41219 470 aa29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MLXIPQ9HAP2 919 aa29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SPTLC2O15270 562 aa29.92■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GH1P01241 217 aa29.92■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DTHD1Q6ZMT9 781 aa29.92■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TECP42680 631 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SP4Q02446 784 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 METTL7BQ6UX53 244 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA32Q96LK8 384 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 GDPD2Q9HCC8 539 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 RCOR1Q9UKL0 485 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 ARHGAP1Q07960 439 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MTFR1Q15390 333 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 IL17AQ16552 155 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM266Q2M3C6 531 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 TLK2Q86UE8 772 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 OR6J1Q8NGC5 347 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MCOLN1Q9GZU1 580 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC9A2Q9UBY0 812 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 VAV3Q9UKW4 847 aa29.91■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 VWA3AA6NCI4 1184 aa29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 RARBP10826 455 aa29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 LAMC2Q13753 1193 aa29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNG4Q8TDN1 519 aa29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.9■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 CHMP2AO43633 222 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP6R2O75170 966 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 ARMC5Q96C12 935 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF333Q96JL9 665 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA33Q96N06 139 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
GGTA1P-201ENST00000373793 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 KRT76Q01546 638 aa29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 FERMT2Q96AC1 680 aa29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 Q9Y3F1 56 aa29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 TELO2Q9Y4R8 837 aa29.88■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 MSCO60682 206 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 CCNE2O96020 404 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 CCL5P13501 91 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 SPIRE1Q08AE8 756 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 PPP2R5CQ13362 524 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 AP5M1Q9H0R1 490 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 RNF208Q9H0X6 261 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 BRCA2P51587 3418 aa29.87■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 POTEMA6NI47 508 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 NOP56O00567 594 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 ME1P48163 572 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 GRIN1Q05586 938 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 NCAPH2Q6IBW4 605 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 RAB34Q9BZG1 259 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 POTEFA5A3E0 1075 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 ACTR2P61160 394 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 AFG1LQ8WV93 481 aa29.86■■■□□ 2.37
GGTA1P-201ENST00000373793 CLIC6Q96NY7 704 aa29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms