RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa3.82□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC12A8A0AV02 714 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAN2B1O00754 1011 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCNK3O14649 394 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC27A2O14975 620 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SGSM2O43147 1006 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 HIP1RO75146 1068 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TADA3O75528 432 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMY2AP04746 511 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 CPEP16870 476 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMY2BP19961 511 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 VIPR1P32241 457 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCNN1BP51168 640 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MECP2P51608 486 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 STRN3Q13033 797 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TUSC3Q13454 348 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP44Q17R89 818 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 HHIPL2Q6UWX4 724 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD1Q719H9 257 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 KIF18BQ86Y91 864 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM48Q8IWZ4 208 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLGN4XQ8N0W4 816 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ALG3Q92685 438 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ORAI3Q9BRQ5 295 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTFR1LQ9H019 292 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ASH2LQ9UBL3 628 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 B4GALT6Q9UBX8 382 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.81□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV5S2A0A599 114 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC10BA6NIK2 292 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 H7C1D1 291 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAF5O00463 557 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRT37O76014 449 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 F2P00734 622 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 GJA4P35212 333 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 IL2P60568 153 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 NFKB2Q00653 900 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 IRF9Q00978 393 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 DSG1Q02413 1049 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHCR24Q15392 516 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLANAQ16655 118 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR23BQ6ZRT6 265 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 OTOP1Q7RTM1 612 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMIGO3Q86WK7 504 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 NOSTRINQ8IVI9 506 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SH3RF2Q8TEC5 729 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP7Q93009 1102 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 GPATCH3Q96I76 525 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 BRINP2Q9C0B6 783 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 BCAS3Q9H6U6 928 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCDH12Q9NPG4 1184 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCM8Q9UJA3 840 aa3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRAMEF25A6NGN4 478 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCDO00767 359 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PEX10O60683 326 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 LTFP02788 710 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 PMLP29590 882 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPHA5P54756 1037 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANAPC15P60006 121 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMPD3Q01432 767 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 OCRLQ01968 901 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRIN1Q05586 938 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCTP1Q6DN14 999 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM132EQ6IEE7 984 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSTL4Q6MZW2 842 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 C11orf74Q86VG3 221 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 MIB1Q86YT6 1006 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM126BQ8IXS8 530 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 NXPE1Q8N323 547 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARRDC4Q8NCT1 418 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATL2Q8NHH9 583 aa3.79□□□□□ -1.8
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX11Q96FC9 970 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms