RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 WISP1O95388 367 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 TM4SF4P48230 202 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 NLRP12P59046 1061 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 DSC3Q14574 896 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBE3CQ15386 1083 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 CERS3Q8IU89 383 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 OPTNQ96CV9 577 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 ASB16Q96NS5 453 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 LNPKQ9C0E8 428 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 STAP2Q9UGK3 403 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSADQ9Y600 493 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 METTL12A8MUP2 240 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERC2O15083 957 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 ITPKAP23677 461 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 GRIA4P48058 902 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 PDE1AP54750 535 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 NUCB1Q02818 461 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 PCDH1Q08174 1060 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 CHD1LQ86WJ1 897 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 LCORLQ8N3X6 602 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 KBTBD3Q8NAB2 608 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF186Q9NXI6 227 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 PALD1Q9ULE6 856 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 DOCK1Q14185 1865 aa8.96□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.96□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 MYH1P12882 1939 aa8.96□□□□□ -0.97
RNU1-38P-201ENST00000362817 MEGF11A6BM72 1044 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 CA12O43570 354 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 LBX1P52954 281 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERO1BQ86YB8 467 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 FBF1Q8TES7 1133 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 DNAJC18Q9H819 358 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARMT1Q9H993 441 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SAGE1Q9NXZ1 904 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PI4KBQ9UBF8 816 aa8.96□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRKAB2O43741 272 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 MBD4O95243 580 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYP11A1P05108 521 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 GSTM4Q03013 218 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPATQ06203 517 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SREBF2Q12772 1141 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPIL2Q13356 520 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 OSBP2Q969R2 916 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PTPN18Q99952 460 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 B3GALT4O96024 378 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 HLA-DOAP06340 250 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLCD1P51178 756 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 INHBEP58166 350 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 FDX2Q6P4F2 183 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 APPBP2Q92624 585 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 USP26Q9BXU7 913 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF576Q9H609 170 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms