RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361496.3

RCSD1-201, Transcript of RCSD domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RCSD1, Length 822 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1-201ENST00000361496 GPR20Q99678 358 aa22.73■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 JADE2Q9NQC1 790 aa22.73■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 H3BRB1 525 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 MAFGO15525 162 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 SEC24BO95487 1268 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 IFNAR1P17181 557 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 SP4Q02446 784 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 MTMR1Q13613 665 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 ANO3Q9BYT9 981 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.72■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 PITPNM1O00562 1244 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 LGALS2P05162 132 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 CLK2P49760 499 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 AP3B2Q13367 1082 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 C6orf50Q9HD87 102 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.71■■□□□ 1.23
RCSD1-201ENST00000361496 IQCF3P0C7M6 154 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 KCNA2P16389 499 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 DEFB128Q7Z7B8 93 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 HERVK_113Q902F9 699 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 IL17RAQ96F46 866 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.7■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ESYT2A0FGR8 921 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CPLX1O14810 134 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ANAPC15P60006 121 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 STK3Q13188 491 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 C8orf34Q49A92 452 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 RASIP1Q5U651 963 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CAGE1Q8TC20 777 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.69■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 GNA11P29992 359 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF76P36508 570 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SREBF1P36956 1147 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 FAM161BQ96MY7 647 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 LAMA3Q16787 3333 aa22.68■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ADAMTS3O15072 1205 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 PFKMP08237 780 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 RFC2P35250 354 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ARHGAP4P98171 946 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 PTK7Q13308 1070 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 HIC1Q14526 733 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CEP55Q53EZ4 464 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 MCTP2Q6DN12 878 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 VWCEQ96DN2 955 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SZT2Q5T011 3432 aa22.67■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ARP10275 920 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 TRIM50Q86XT4 487 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 BICD2Q8TD16 824 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.228e-7■■■□□ 16.7
RCSD1-201ENST00000361496 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.66■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SCN5AQ14524 2016 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 GRXCR1A8MXD5 290 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 MEIS1O00470 390 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 CKBP12277 381 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SELPP16109 830 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.65■■□□□ 1.22
RCSD1-201ENST00000361496 ZBBXA8MT70 800 aa22.64■■□□□ 1.21
RCSD1-201ENST00000361496 ACTN1P12814 892 aa22.64■■□□□ 1.21
RCSD1-201ENST00000361496 NLRP5P59047 1200 aa22.64■■□□□ 1.21
RCSD1-201ENST00000361496 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms