RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ELMOD1Q8N336 334 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SETD4Q9NVD3 440 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A2Q9UBY0 812 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NCOR1O75376 2440 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 POTEB3A0JP26 581 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ICAM1P05362 532 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF286BP0CG31 522 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ASIC1P78348 528 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ARID5AQ03989 594 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM60Q495X7 471 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 POTEBQ6S5H4 581 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 FIBCD1Q8N539 461 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MYCT1Q8N699 235 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 VTA1Q9NP79 307 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SALL1Q9NSC2 1324 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 VWA3AA6NCI4 1184 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TADA2AO75478 443 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KRT13P13646 458 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 STAT6P42226 847 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CLUL1Q15846 466 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LY6KQ17RY6 165 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RUFY3Q7L099 469 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ADGRA1Q86SQ6 560 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GAKO14976 1311 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 XPOTO43592 962 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TPM1P09493 284 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 OR1G1P47890 313 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LIG4P49917 911 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SLC8A3P57103 927 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM132BQ14DG7 1078 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RAB30Q15771 203 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DSTYKQ6XUX3 929 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NEK8Q86SG6 692 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PGBD3Q8N328 593 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 STAG2Q8N3U4 1231 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 BADQ92934 168 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SNX21Q969T3 373 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SCLYQ96I15 445 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 CFAP45Q9UL16 551 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 POTEFA5A3E0 1075 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TBKBP1A7MCY6 615 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 WDR64B1ANS9 1081 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NEMFO60524 1076 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 IQCEQ6IPM2 695 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 LBX2Q6XYB7 198 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 COPS5Q92905 334 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KIF2CQ99661 725 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TSG101Q99816 390 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SYNCQ9H7C4 482 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DISC1Q9NRI5 854 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PSEN2P49810 448 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ACLYP53396 1101 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KRT85P78386 507 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 KRT76Q01546 638 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 PPP2R5AQ15172 486 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 METTL23Q86XA0 190 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TBCKQ8TEA7 893 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TMX3Q96JJ7 454 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 MMS19Q96T76 1030 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 SPEF2Q9C093 1822 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRC-201ENST00000348564 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.94□□□□□ -1.62
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