RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 HGSO14964 777 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CAMTA2O94983 1202 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CDHR1Q96JP9 859 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TMEM260Q9NX78 707 aa22.6■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CCND2P30279 289 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 KIF11P52732 1056 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GNGT1P63211 74 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SERPING1P05155 500 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PPFIA4O75335 1185 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TMOD1P28289 359 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PRCPP42785 496 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.215e-10■■■□□ 17.7
NISCH-201ENST00000345716 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.211e-6■■□□□ 13.2
NISCH-201ENST00000345716 ASNSP08243 561 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.59■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 MYO1FO00160 1098 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ECE2O60344 883 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ZMYND10O75800 440 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CXCR5P32302 372 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 CASC4Q6P4E1 433 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 FAM71BQ8TC56 605 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 LGSNQ5TDP6 509 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 HACE1Q8IYU2 909 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 FTCDO95954 541 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ATP1A2P50993 1020 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 TXNRD1Q16881 649 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 POTEDQ86YR6 584 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.58■■□□□ 1.21
NISCH-201ENST00000345716 ZSCAN26Q16670 478 aa22.58■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 C12orf60Q5U649 245 aa22.58■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 MGARPQ8TDB4 240 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 FOXN1O15353 648 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PPM1EQ8WY54 764 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 TFDP1Q14186 410 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PPP2R5DQ14738 602 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ZNF653Q96CK0 615 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 SFI1A8K8P3 1242 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 LGALS16A8MUM7 142 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 KRT81Q14533 505 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 STIM2Q9P246 746 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ATP8B1O43520 1251 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PP2D1A8MPX8 630 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 MXI1P50539 228 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 HESX1Q9UBX0 185 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ARHGAP25P42331 645 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 VSIG1Q86XK7 387 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 DIP2BQ9P265 1576 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 C2orf54Q08AI8 447 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 RAD54LQ92698 747 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 MTERF2Q49AM1 385 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 CD163L1Q9NR16 1453 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 E9PMD0 336 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 P3H4Q92791 437 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PARD6BQ9BYG5 372 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PASKQ96RG2 1323 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 GPR162Q16538 588 aa22.55■■□□□ 1.2
NISCH-201ENST00000345716 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.55■■□□□ 1.2
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