RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342316.8

CSRNP3-202, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP3, Length 11,684 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3-202ENST00000342316 SPATA1Q5VX52 437 aa4.71□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.71□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CRLF3Q8IUI8 442 aa4.71□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MSANTD3Q96H12 275 aa4.71□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 TRIM31Q9BZY9 425 aa4.71□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PASKQ96RG2 1323 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ADCK5Q3MIX3 580 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 GIMAP6Q6P9H5 292 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KLHL17Q6TDP4 642 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 FERMT3Q86UX7 667 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 TNIP3Q96KP6 325 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MGAT4AQ9UM21 535 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 LAYNQ6UX15 382 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PANK1Q8TE04 598 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 HSPH1Q92598 858 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MLXQ9UH92 298 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PRMT3O60678 531 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SERPINB3P29508 390 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ADCY8P40145 1251 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 HSPA13P48723 471 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KRT81Q14533 505 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 EPC2Q52LR7 807 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 RASSF3Q86WH2 238 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 APOL4Q9BPW4 351 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KRT37O76014 449 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 RALBP11234 206 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PTPN6P29350 595 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 HNMTP50135 292 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MTERF2Q49AM1 385 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CNNM4Q6P4Q7 775 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MOSPD2Q8NHP6 518 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CEP44Q9C0F1 390 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 RTEL1Q9NZ71 1219 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 STK24Q9Y6E0 443 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 FAM92AA1XBS5 289 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 RGS10O43665 173 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 STARP49675 285 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 DRP2Q13474 957 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ADRM1Q16186 407 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CAVIN4Q5BKX8 364 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 TBC1D19Q8N5T2 526 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 HAVCR1Q96D42 359 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KCNH8Q96L42 1107 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 THTPAQ9BU02 230 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 KATNAL1Q9BW62 490 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MYCP01106 439 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MSH3P20585 1137 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PIK3R1P27986 724 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 STX5Q13190 355 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 C1orf146Q5VVC0 180 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 TTC17Q96AE7 1141 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CCDC51Q96ER9 411 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ARIH2O95376 493 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CCDC130P13994 396 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ARPC4P59998 168 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 VBP1P61758 197 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 MAP3K12Q12852 859 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 DLG1Q12959 904 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 STK4Q13043 487 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 STK32CQ86UX6 486 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SLC26A7Q8TE54 656 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ADCY7P51828 1080 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PRKG2Q13237 762 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PDZK1Q5T2W1 519 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ENKURQ8TC29 256 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 CALML6Q8TD86 181 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 SLC10A4Q96EP9 437 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 RETREG1Q9H6L5 497 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 AXIN2Q9Y2T1 843 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 A0A0X1KG70 313 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 F8W810 466 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 ZNF806P0C7X5 589 aa4.7□□□□□ -1.66
CSRNP3-202ENST00000342316 PLCG2P16885 1265 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms