RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332345.10

LIMS1-201, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-201ENST00000332345 CYP2W1Q8TAV3 490 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 RASGRP4Q8TDF6 673 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 BCAS3Q9H6U6 928 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 PDLIM7Q9NR12 457 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.96■□□□□ 0.15
LIMS1-201ENST00000332345 KIAA0355O15063 1070 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ATP9AO75110 1047 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CD4P01730 458 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KCNA2P16389 499 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 MCM2P49736 904 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CHMP4BP1P59074 171 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TRIM29Q14134 588 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FAM126BQ8IXS8 530 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SDF4Q9BRK5 362 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.95■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TRIM43BA6NCK2 446 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ARP10275 920 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 RAG1P15918 1043 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FAM47CQ5HY64 1035 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CHRDL2Q6WN34 429 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KAT2BQ92831 832 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 GPR20Q99678 358 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 NFASCO94856 1347 aa15.94■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FAM86B1E9PN63 330 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 M0R2N6 131 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 JAK2O60674 1132 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 DTNBO60941 627 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CIITAP33076 1130 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 BMP8BP34820 402 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PSEN2P49810 448 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SETQ01105 290 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SP4Q02446 784 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 MFSD10Q14728 455 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 C7orf31Q8N865 590 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TBCKQ8TEA7 893 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 GDF15Q99988 308 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TRPV6Q9H1D0 765 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 H3BRB1 525 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 HAS3O00219 553 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 B4GALT4O60513 344 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 F2P00734 622 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TIMP1P01033 207 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ZNF286BP0CG31 522 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 NPY5RQ15761 445 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KIAA0753Q2KHM9 967 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PRR16Q569H4 304 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SESTD1Q86VW0 696 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TBC1D22BQ9NU19 505 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TBX21Q9UL17 535 aa15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 LGALS2P05162 132 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KRT2P35908 639 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ST3GAL1Q11201 340 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 FAM184AQ8NB25 1140 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 BADQ92934 168 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 ZNF577Q9BSK1 485 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 NOD1Q9Y239 953 aa15.91■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 KAT6AQ92794 2004 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 CYP3A7P24462 503 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 PTGISQ16647 500 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 HIPK3Q9H422 1215 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa15.9■□□□□ 0.14
LIMS1-201ENST00000332345 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms