RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 AFG1LQ8WV93 481 aa30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 SDF4Q9BRK5 362 aa30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.38■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 NFASCO94856 1347 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 CABYRO75952 493 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 COL6A1P12109 1028 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 MCTP1Q6DN14 999 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 MBOAT7Q96N66 472 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP30.37■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 PPFIA4O75335 1185 aa30.36■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 DGKDQ16760 1214 aa30.36■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 TBC1D22BQ9NU19 505 aa30.36■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP30.36■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 FAM205CA6NFA0 338 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 NOP56O00567 594 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 TDP2O95551 362 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 LENG9Q96B70 501 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 GLT1D1Q96MS3 346 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 BCAS3Q9H6U6 928 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.35■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 MMP3P08254 477 aa30.34■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 HSDL1Q3SXM5 330 aa30.34■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 SORBS3O60504 671 aa30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 SYT1P21579 422 aa30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 FERMT2Q96AC1 680 aa30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 ELP1O95163 1332 aa30.32■■■□□ 2.45
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 A0A1W2PQY0 241 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 KIF28PB7ZC32 967 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 MSH4O15457 936 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 MYL3P08590 195 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC10P48553 1259 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 PURAQ00577 322 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.32■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 CXCL17Q6UXB2 119 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SEPT1Q8WYJ6 367 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 RIT2Q99578 217 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 GPR20Q99678 358 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 HTATIP2Q9BUP3 242 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 STARD7Q9NQZ5 370 aa30.31■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 TBX3O15119 743 aa30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 DHX15O43143 795 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 FAM20AQ96MK3 541 aa30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa30.3■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC5A5Q92911 643 aa30.29■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLC37A4O43826 429 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 BAG4O95429 457 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 ATP2B1P20020 1258 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SP4Q02446 784 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.28■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 STX6O43752 255 aa30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH6O60337 910 aa30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 KRT76Q01546 638 aa30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf53Q5VUE5 145 aa30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 GAS7O60861 476 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 RILPL1Q5EBL4 403 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 LRCH2Q5VUJ6 765 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 BRAPQ7Z569 592 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 SLFN12Q8IYM2 578 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 KAT6AQ92794 2004 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 UIMC1Q96RL1 719 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 KATNAL1Q9BW62 490 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 TEKT3Q9BXF9 490 aa30.26■■■□□ 2.44
CRIP1-201ENST00000330233 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 NEMFO60524 1076 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 ATG7O95352 703 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 ACTR2P61160 394 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 TTC38Q5R3I4 469 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 WDR81Q562E7 1941 aa30.25■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 PSMD10O75832 226 aa30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 MCM7P33993 719 aa30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA7Q13683 1181 aa30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 LGALS2P05162 132 aa30.23■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 SNX17Q15036 470 aa30.23■■■□□ 2.43
CRIP1-201ENST00000330233 CALCRLQ16602 461 aa30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms