RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFB3P10600 412 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOXD10P28358 340 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R5CQ13362 524 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALML4Q96GE6 196 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 VTA1Q9NP79 307 aa30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP2AO43633 222 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SEMA3FQ13275 785 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGEF6Q15052 776 aa30.85■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDILTQ8N807 584 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNX29Q8TEQ0 813 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PANK2Q9BZ23 570 aa30.85■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF202O95125 648 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ENGASEQ8NFI3 743 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 ERO1AQ96HE7 468 aa30.84■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa30.84■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPIRE1Q08AE8 756 aa30.83■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC45AQ9H3U1 944 aa30.83■■■□□ 2.53
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KRT76Q01546 638 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTLL4Q14679 1199 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 OLFML2BQ68BL8 750 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD99L2Q8TCZ2 262 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCFD2Q8WU76 684 aa30.83■■■□□ 2.53
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC26A4O43511 780 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 NEDD9Q14511 834 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 KARSQ15046 597 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 IQUBQ8NA54 791 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC34Q96HJ3 373 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 SAMM50Q9Y512 469 aa30.82■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa30.81■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 FLT3LGP49771 235 aa30.81■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DHX58Q96C10 678 aa30.81■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC183Q5T5S1 534 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP62CLQ9H1M0 184 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9A2Q9UBY0 812 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 GABRQQ9UN88 632 aa30.8■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 SFNP31947 248 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAT6P42226 847 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 JAK3P52333 1124 aa30.79■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EPHA7Q15375 998 aa30.79■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FLRT1Q9NZU1 646 aa30.78■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
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CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 RDM1Q8NG50 284 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLIN2Q99541 437 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLSTN2Q9H4D0 955 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLXIPQ9HAP2 919 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDGFCQ9NRA1 345 aa30.78■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A087X0B3 334 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPA1P27694 616 aa30.77■■■□□ 2.52
CTDNEP1-201ENST00000318988 LONRF3Q496Y0 759 aa30.77■■■□□ 2.52
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