RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317932.11

KCTD1-201, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene KCTD1, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD1-201ENST00000317932 SLFN13Q68D06 897 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 RAD9BQ6WBX8 426 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 SLFN12Q8IYM2 578 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 CPLX3Q8WVH0 158 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 RAD54LQ92698 747 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 MBOAT7Q96N66 472 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 PNMA5Q96PV4 448 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
KCTD1-201ENST00000317932 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TMEM88BA6NKF7 163 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 USP17L10C9JJH3 530 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EEF2P13639 858 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EIF6P56537 245 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 NFIAQ12857 509 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PTPN21Q16825 1174 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 FAM71BQ8TC56 605 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 KIFC2Q96AC6 838 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PLIN2Q99541 437 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 DNAJC7Q99615 494 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MXD3Q9BW11 206 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 DBNDD1Q9H9R9 158 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MED4Q9NPJ6 270 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SIPA1L1O43166 1804 aa11.64□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 A0A1W2PQJ5 194 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SLC37A4O43826 429 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EDIL3O43854 480 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TDP2O95551 362 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MCM3P25205 808 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 RFC5P40937 340 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 LMAN1P49257 510 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MMP14P50281 582 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CDK17Q00537 523 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ATP2B2Q01814 1243 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 STK4Q13043 487 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ANKRD40Q6AI12 368 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TTBK2Q6IQ55 1244 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 KIAA0825Q8IV33 1275 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 LRRC15Q8TF66 581 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PPM1EQ8WY54 764 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ERGIC2Q96RQ1 377 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TSG101Q99816 390 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 AMNQ9BXJ7 453 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TRIM49BA6NDI0 452 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PMS1P54277 932 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 KRT83P78385 493 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ICA1Q05084 483 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ABCB5Q2M3G0 1257 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 QRICH1Q2TAL8 776 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ICE2Q659A1 982 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 BTNL9Q6UXG8 535 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 KCTD1Q719H9 257 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CCDC170Q8IYT3 715 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 VPS33BQ9H267 617 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 DNAJC18Q9H819 358 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 VIPAS39Q9H9C1 493 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MYMKA6NI61 221 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CHMP4BP1P59074 171 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 ZBED6P86452 979 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 EHHADHQ08426 723 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MEA1Q16626 185 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 HSP90B2PQ58FF3 399 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 HAS1Q92839 578 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 SYT17Q9BSW7 474 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.62□□□□□ -0.55
KCTD1-201ENST00000317932 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms