RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314675.11

UBXN11-201, Transcript of UBX domain protein 11, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene UBXN11, Length 2,254 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11-201ENST00000314675 IL31RAQ8NI17 732 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 THAP9Q9H5L6 903 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PANK4Q9NVE7 773 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PNMA2Q9UL42 364 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CHMP2AO43633 222 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 GAS7O60861 476 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 DSG3P32926 999 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 COASYQ13057 564 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PPP2R5CQ13362 524 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 VGLL4Q14135 290 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 COG2Q14746 738 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CENPPQ6IPU0 288 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TAB2Q9NYJ8 693 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 REPS2Q8NFH8 660 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PARP14Q460N5 1801 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 MAP3K9P80192 1104 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TMX1Q9H3N1 280 aa22.18■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RLFQ13129 1914 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SLITRK3O94933 977 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 LRRC41Q15345 812 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 NSMFQ6X4W1 530 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TC2NQ8N9U0 490 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 USP27XA6NNY8 438 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RNF146Q9NTX7 359 aa22.16■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 NRDCO43847 1150 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 BCRP11274 1271 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 FAM26FQ5R3K3 315 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TPH2Q8IWU9 490 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CCDC65Q8IXS2 484 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TBC1D7Q9P0N9 293 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 OAZ1P54368 228 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 DYDC2Q96IM9 177 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RMDN3Q96TC7 470 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 FRMD3A2A2Y4 597 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 GIT2Q14161 759 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 PGM5Q15124 567 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CEP135Q66GS9 1140 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 CCDC112Q8NEF3 446 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 RIT2Q99578 217 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN11-201ENST00000314675 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 RBL2Q08999 1139 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 TKFCQ3LXA3 575 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.14■■□□□ 1.13
UBXN11-201ENST00000314675 UBXN1Q04323 297 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms