RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SFNP31947 248 aa14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 ME3Q16798 604 aa14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HHATQ5VTY9 493 aa14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DONSONQ9NYP3 566 aa14.77□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BNIP3LO60238 219 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HUS1O60921 280 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HMGCS2P54868 508 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 C9orf131Q5VYM1 1079 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PFKFB1P16118 471 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM186BQ8IYM0 893 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DPF3Q92784 378 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
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PDGFRB-201ENST00000261799 SATB1Q01826 763 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MTMR2Q13614 643 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 OR6B2Q6IFH4 312 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CDC42EP1Q00587 391 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PSMD2Q13200 908 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 KYAT1Q16773 422 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS6KA2Q15349 733 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MAPK6Q16659 721 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PGBD4Q96DM1 585 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NUDT12Q9BQG2 462 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RAB17Q9H0T7 212 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 AXIN2Q9Y2T1 843 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 C8orf34Q49A92 452 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PPP4R1Q8TF05 950 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 AFPP02771 609 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CHMP6Q96FZ7 201 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 BTBD18B2RXH4 712 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SLC4A1P02730 911 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TGFB2P61812 414 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 DGKHQ86XP1 1220 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CTAGE3PQ8IX95 158 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 EPSTI1Q96J88 318 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.75□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RNF180Q86T96 592 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CCDC51Q96ER9 411 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CPB1P15086 417 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 MB21D1Q8N884 522 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CDKL2Q92772 493 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 CYP2B6P20813 491 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NR2F2P24468 414 aa14.74□□□□□ -0.05
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PDGFRB-201ENST00000261799 PSMD14O00487 310 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 IFNB1P01574 187 aa14.74□□□□□ -0.05
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PDGFRB-201ENST00000261799 GSTA2P09210 222 aa14.74□□□□□ -0.05
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF280CQ8ND82 737 aa14.74□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GPC3P51654 580 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 APOA5Q6Q788 366 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 IQSEC2Q5JU85 1478 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 NEMP1O14524 444 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 ARHGAP4P98171 946 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.73□□□□□ -0.05
PDGFRB-201ENST00000261799 FBXO41Q8TF61 875 aa14.73□□□□□ -0.05
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