RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261333.10

ZNF397-201, Transcript of zinc finger protein 397, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF397, Length 1,419 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397-201ENST00000261333 METTL7BQ6UX53 244 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 GPRASP2Q96D09 838 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 UIMC1Q96RL1 719 aa18.29■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 KAT6AQ92794 2004 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 ESYT2A0FGR8 921 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 LGALS2P05162 132 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 ACRP10323 421 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 SREBF1P36956 1147 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 NECAB1Q8N987 351 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 IL17RAQ96F46 866 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 SCLYQ96I15 445 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 GPR20Q99678 358 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 C6orf50Q9HD87 102 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 JADE2Q9NQC1 790 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 HDAC6Q9UBN7 1215 aa18.28■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 TET1Q8NFU7 2136 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 GBF1Q92538 1859 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 NEK4P51957 841 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 ARHGAP4P98171 946 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 CTAGE1Q96RT6 745 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 MXRA8Q9BRK3 442 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 C16orf70Q9BSU1 422 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 NOD1Q9Y239 953 aa18.27■□□□□ 0.52
ZNF397-201ENST00000261333 HAS3O00219 553 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 PFKFB2O60825 505 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SLC34A2O95436 690 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 FOSP01100 380 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ARP10275 920 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 HIC1Q14526 733 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 PTGISQ16647 500 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 C7orf31Q8N865 590 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CCDC148Q8NFR7 591 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SENP7Q9BQF6 1050 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GLT8D2Q9H1C3 349 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 KCNH7Q9NS40 1196 aa18.26■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 PPFIA4O75335 1185 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 DEXIO95424 95 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CTDNEP1O95476 244 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ME3Q16798 604 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 LRIT3Q3SXY7 679 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CEP55Q53EZ4 464 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 WDR81Q562E7 1941 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM199Q8N511 208 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CDHR1Q96JP9 859 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa18.25■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 FAM86B1E9PN63 330 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 FAM86B2P0C5J1 330 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GNA11P29992 359 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ZNF76P36508 570 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 NLRP5P59047 1200 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ANKRD1Q15327 319 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SESTD1Q86VW0 696 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 WNT8BQ93098 351 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GJB4Q9NTQ9 266 aa18.24■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 H3BRB1 525 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GTF3C6Q969F1 213 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 KCNJ14Q9UNX9 436 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 MARK3P27448 753 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 ST3GAL1Q11201 340 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 NPY5RQ15761 445 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 TMEM240Q5SV17 173 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 DEFB128Q7Z7B8 93 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 TEX2Q8IWB9 1127 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 BICD2Q8TD16 824 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 VWCEQ96DN2 955 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 KIF2CQ99661 725 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 SH3GLB2Q9NR46 395 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CHD7Q9P2D1 2997 aa18.23■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 CHD9Q3L8U1 2897 aa18.22■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 STK36Q9NRP7 1315 aa18.22■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa18.22■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.22■□□□□ 0.51
ZNF397-201ENST00000261333 MEIS1O00470 390 aa18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms