RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 POLLQ9UGP5 575 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L10A6NI86 522 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 RASSF10A6NK89 507 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KCNK3O14649 394 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ODF2Q5BJF6 829 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 EHD4Q9H223 541 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CHD4Q14839 1912 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 POTEFA5A3E0 1075 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CEP104O60308 925 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 POTEIP0CG38 1075 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PDXDC1Q6P996 788 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 POTEGQ6S5H5 508 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.31■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 IFT20Q8IY31 132 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 DNM3Q9UQ16 869 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 A0A1W2PQJ5 194 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 STIM2Q9P246 746 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 NFU1Q9UMS0 254 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TOM1O60784 492 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CLSTN1O94985 981 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 NT5C2P49902 561 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SEMA3FQ13275 785 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PDIA5Q14554 519 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PACS2Q86VP3 889 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.3■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GNGT1P63211 74 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ZNF543Q08ER8 600 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PSMD2Q13200 908 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PLS1Q14651 629 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 VPS36Q86VN1 386 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 DNAAF5Q86Y56 855 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB5O15062 677 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 BBOX1O75936 387 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GCNT3O95395 438 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CCT5P48643 541 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SFI1A8K8P3 1242 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CLIC2O15247 247 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 MTMR9Q96QG7 549 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.29■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 BCL9LQ86UU0 1499 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SERPING1P05155 500 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 RHBDL3P58872 404 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 HAUS3Q68CZ6 603 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SLFN13Q68D06 897 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CREG2Q8IUH2 290 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 MTMR8Q96EF0 704 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SIK3Q9Y2K2 1263 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 EBAG9O00559 213 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ACTN1P12814 892 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 RPS6KA1Q15418 735 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 H0YHG0 523 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 FIGNQ5HY92 759 aa20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PPFIA1Q13136 1202 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 ECM1Q16610 540 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 TEKT1Q969V4 418 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 GDF11O95390 407 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 KCNH2Q12809 1159 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 CEP72Q9P209 647 aa20.27■□□□□ 0.84
LRP3-201ENST00000253193 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 EPHB4P54760 987 aa20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ANO3Q9BYT9 981 aa20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 VIPAS39Q9H9C1 493 aa20.27■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 ESYT2A0FGR8 921 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 GNA14O95837 355 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 KLRC1P26715 233 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 COL4A1P02462 1669 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.26■□□□□ 0.83
LRP3-201ENST00000253193 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms