RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 PLXNB2O15031 1838 aa21.55■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 NLRP12P59046 1061 aa21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 MCM6Q14566 821 aa21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 KIAA1024Q9UPX6 916 aa21.54■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 PPP2R5CQ13362 524 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 MMP19Q99542 508 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 ANO10Q9NW15 660 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 E9PMD0 336 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 ZNF165P49910 485 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 GRM1Q13255 1194 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 HYIQ5T013 277 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.53■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 PSMC6P62333 389 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 DNERQ8NFT8 737 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 RAD54LQ92698 747 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 TEKT3Q9BXF9 490 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 DOCK3Q8IZD9 2030 aa21.52■■□□□ 1.04
DUSP1-201ENST00000239223 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 MORC3Q14149 939 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 MROH8Q9H579 483 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CPA4Q9UI42 421 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SORBS3O60504 671 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 KCTD2Q14681 263 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 XRRA1Q6P2D8 792 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 DYDC2Q96IM9 177 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 RIT2Q99578 217 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 MAF1Q9H063 256 aa21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 TOMM70O94826 608 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 RPA1P27694 616 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 IQCB1Q15051 598 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CUEDC2Q9H467 287 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 STK17AQ9UEE5 414 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 MYMKA6NI61 221 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 KLRC4O43908 158 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 FCER1AP12319 257 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 EDNRBP24530 442 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 IWS1Q96ST2 819 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 HSD17B14Q9BPX1 270 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 TRIM9Q9C026 710 aa21.5■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 WDR81Q562E7 1941 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 HTTP42858 3142 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 ZBTB39O15060 712 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SLITRK3O94933 977 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SMC2O95347 1197 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CCNE2O96020 404 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 COPB2P35606 906 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 EEPD1Q7L9B9 569 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 GPRASP2Q96D09 838 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.49■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 AP5Z1O43299 807 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 KCNA2P16389 499 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SP2Q02086 613 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 STXBP2Q15833 593 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 IFNL1Q8IU54 200 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 ERMNQ8TAM6 284 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CEP350Q5VT06 3117 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 COBLO75128 1261 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 SV2BQ7L1I2 683 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 DYMQ7RTS9 669 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 BANK1Q8NDB2 785 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 GSDMAQ96QA5 445 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
DUSP1-201ENST00000239223 ADORA2AP29274 412 aa21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms