RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 SLC16A2P36021 539 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 TDO2P48775 406 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 ITPRIPQ8IWB1 547 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 KAT6AQ92794 2004 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 OSBP2Q969R2 916 aa19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 B4DLN1 442 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC96Q2M329 555 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 SYDE2Q5VT97 1194 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 SEPT14Q6ZU15 432 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM105Q8N8V8 129 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 SUSD6Q92537 303 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 IL17RBQ9NRM6 502 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 CHD8Q9HCK8 2581 aa19.37■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
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SPCS1-201ENST00000233025 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.36■□□□□ 0.69
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SPCS1-201ENST00000233025 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 PPTC7Q8NI37 304 aa19.36■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 DCAF4Q8WV16 495 aa19.36■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 PPP2R3CQ969Q6 453 aa19.36■□□□□ 0.69
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SPCS1-201ENST00000233025 PLAGL2Q9UPG8 496 aa19.36■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 SSUH2Q9Y2M2 353 aa19.36■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 GPAA1O43292 621 aa19.35■□□□□ 0.69
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SPCS1-201ENST00000233025 USP24Q9UPU5 2620 aa19.34■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 NOVP48745 357 aa19.34■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 APPBP2Q92624 585 aa19.34■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 APBB2Q92870 758 aa19.34■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 P2RX5Q93086 422 aa19.34■□□□□ 0.69
SPCS1-201ENST00000233025 CAND2O75155 1236 aa19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 CTSHP09668 335 aa19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 GNAT2P19087 354 aa19.33■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 BCL11AQ9H165 835 aa19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 PNMA2Q9UL42 364 aa19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 DOCK5Q9H7D0 1870 aa19.33■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa19.32■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa19.32■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 M0R2C6 588 aa19.31■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 SPPL3Q8TCT6 385 aa19.31■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0A1Q93050 837 aa19.31■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa19.31■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa19.31■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 COL20A1Q9P218 1284 aa19.31■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf102A2RUQ5 167 aa19.3■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 TREHO43280 583 aa19.3■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 C16orf70Q9BSU1 422 aa19.3■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa19.3■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 TSPY2A6NKD2 308 aa19.29■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 RBM10P98175 930 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 STXBP2Q15833 593 aa19.29■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 VN1R2Q8NFZ6 395 aa19.29■□□□□ 0.68
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SPCS1-201ENST00000233025 ATP8B4Q8TF62 1192 aa19.29■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.29■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 GPCPD1Q9NPB8 672 aa19.29■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 HSDL1Q3SXM5 330 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 KREMEN2Q8NCW0 462 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 POF1BQ8WVV4 589 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 TBC1D5Q92609 795 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 IWS1Q96ST2 819 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SPCS1-201ENST00000233025 RAB11FIP3O75154 756 aa19.27■□□□□ 0.68
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