RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 PAK2Q13177 524 aa24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1-201ENST00000218364 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1-201ENST00000218364 EMC10Q5UCC4 262 aa24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1-201ENST00000218364 GNA14O95837 355 aa24.4■■□□□ 1.5
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HTATSF1-201ENST00000218364 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
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HTATSF1-201ENST00000218364 SLC18A3Q16572 532 aa24.4■■□□□ 1.5
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HTATSF1-201ENST00000218364 CD302Q8IX05 232 aa24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX11Q8IYF3 940 aa24.4■■□□□ 1.5
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HTATSF1-201ENST00000218364 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.39■■□□□ 1.49
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HTATSF1-201ENST00000218364 PANK4Q9NVE7 773 aa24.39■■□□□ 1.49
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HTATSF1-201ENST00000218364 TNNI2P48788 182 aa24.35■■□□□ 1.49
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HTATSF1-201ENST00000218364 KRT12Q99456 494 aa24.35■■□□□ 1.49
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HTATSF1-201ENST00000218364 ESYT3A0FGR9 886 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1-201ENST00000218364 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1-201ENST00000218364 USP38Q8NB14 1042 aa24.34■■□□□ 1.49
HTATSF1-201ENST00000218364 CD209Q9NNX6 404 aa24.34■■□□□ 1.49
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