RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 C12orf60Q5U649 245 aa25.15■■□□□ 1.62
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ANKRD54-201ENST00000215941 CAPN7Q9Y6W3 813 aa25.15■■□□□ 1.62
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ANKRD54-201ENST00000215941 C10orf76Q5T2E6 689 aa25.13■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 UFL1O94874 794 aa25.12■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 FAM153BP0C7A2 387 aa25.12■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 CERS3Q8IU89 383 aa25.12■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 MS4A14Q96JA4 679 aa25.12■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 CCT8L2Q96SF2 557 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ISCUQ9H1K1 167 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 GGA1Q9UJY5 639 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 BBOX1O75936 387 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 KCNMA1Q12791 1236 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 USP38Q8NB14 1042 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 LRRC45Q96CN5 670 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 CEP63Q96MT8 703 aa25.11■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 MTMR9Q96QG7 549 aa25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.11■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 TSPY3P0CV98 308 aa25.1■■□□□ 1.61
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ANKRD54-201ENST00000215941 VCPKMTQ9H867 229 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP8B3O60423 1300 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 SMTNP53814 917 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 GUCY1A3Q02108 690 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 BIRC3Q13489 604 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.1■■□□□ 1.61
ANKRD54-201ENST00000215941 SOGA3Q5TF21 947 aa25.1■■□□□ 1.61
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