RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000167111.5

Rabggtb-202, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Casp12O08736 419 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dsg3O35902 993 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mtco1P00397 514 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700013D24RikQ0P521 120 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Spty2d1Q68FG3 682 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Enpp3Q6DYE8 874 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dusp11Q6NXK5 321 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyfip1Q7TMB8 1253 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Epha10Q8BYG9 1007 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 N4bp3Q8C7U1 537 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr11Q8K1X1 1223 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Acat1Q8QZT1 424 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ccdc96Q9CR92 584 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Armcx1Q9CX83 456 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Asah2Q9JHE3 756 aa12.64□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 LctF8VPT3 1931 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Pgap3A2A559 320 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dhtkd1A2ATU0 921 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm4758L7N258 96 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Slc16a2O70324 545 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 NeflP08551 543 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 EporP14753 507 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Arhgef2Q60875 985 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Inppl1Q6P549 1257 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 C6.1alQ7M757 291 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cdca8Q8BHX3 289 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Bcas3Q8CCN5 928 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fmnl1Q9JL26 1094 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Myo7aP97479 2215 aa12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Angpt1O08538 498 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Phox2bO35690 314 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gnrh1P13562 90 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mov10P23249 1004 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp17a1P27786 507 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gbp1Q01514 589 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp2e1Q05421 493 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 PcQ05920 1178 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cnnm3Q32NY4 713 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cnnm2Q3TWN3 875 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FcgrtQ61559 365 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Myl10Q62082 202 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Wdr44Q6NVE8 915 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Znf689Q8BKK5 500 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 AtripQ8BMG1 785 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 VcpkmtQ8C436 228 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gas2l1Q8JZP9 678 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tbc1d13Q8R3D1 400 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrrfip2Q91WK0 415 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Krt84Q99M73 603 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zbtb43Q9DAI4 467 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Riok3Q9DBU3 519 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tmod3Q9JHJ0 352 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Homer1Q9Z2Y3 366 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfp292Q9Z2U2 2698 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ankrd16A2AS55 361 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Tulp2P46686 562 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyb5r4Q3TDX8 528 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nlrx1Q3TL44 975 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Prdm1Q60636 856 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dhx37Q6NZL1 1150 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Terb1Q8C0V1 768 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Dcaf8Q8N7N5 591 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Supt16hQ920B9 1047 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Plagl2Q925T4 496 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Rassf3Q99P51 232 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mageb3Q9D2H4 330 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 FibpQ9JI19 357 aa12.62□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lipo1J3QME6 396 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nfil3O08750 462 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Itgb5O70309 798 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Camk4P08414 469 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mboat4P0C7A3 435 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 MecomP14404 1042 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Sec23aQ01405 765 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm29609Q3UU56 907 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Jakmip3Q5DTN8 844 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Nsrp1Q5NCR9 542 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Satb1Q60611 764 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Antxr2Q6DFX2 487 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Mtmr10Q7TPM9 771 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Lrrc15Q80X72 579 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gtf3c2Q8BL74 907 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm5114W4VSN8 858 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Ttc6G3UYY4 1857 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa12.61□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa12.6□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Fmr1P35922 614 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
Rabggtb-202ENSMUST00000167111 Cd86P42082 309 aa12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.3 ms