RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inpp5jP59644 1003 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Actr2P61161 394 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mgat3Q10470 538 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Entpd7Q3TCT4 606 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrfip1Q3UZ39 729 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nap1l4Q78ZA7 375 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gga3Q8BMI3 718 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NcaphQ8C156 731 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oit3Q8R4V5 546 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CrygnQ8VHL5 183 aa25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atad5Q4QY64 1826 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rabep1O35551 862 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kif5bQ61768 963 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acnat2Q8BGG9 420 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dmtf1Q8CE22 761 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmco4Q91WU4 631 aa25.74■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adamts9E9PUN6 1931 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sptlc1O35704 473 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lta4hP24527 611 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gjb4Q02738 266 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gja6Q6S5G4 283 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem60Q8K174 133 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dph6Q9CQ28 267 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl7bQ9DD20 244 aa25.73■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smim10l2aA0A0B4J1F8 78 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cdc25aP48964 514 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm11487Q5RIS0 354 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp4x1Q6A152 507 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt87Q6IMF0 495 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 NostrinQ6WKZ7 506 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp20Q8C6M1 916 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hs2st1Q8R3H7 356 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pold3Q9EQ28 462 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trip11E9Q512 1976 aa25.72■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zscan4-ps1A0A1C7CYV3 506 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MafgO54790 162 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mpp3O88910 568 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp2f2P33267 491 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CebpaP53566 359 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ephb4P54761 987 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6v1dP57746 247 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rit2P70425 217 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm3414Q3TNU4 584 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc36Q3V0M2 755 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Syce2Q505B8 171 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 FcgrtQ61559 365 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Azin2Q8BVM4 459 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fermt2Q8CIB5 680 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Arhgap8Q9CXP4 425 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Saal1Q9D2C2 474 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Foxe3Q9QY14 288 aa25.71■■□□□ 1.71
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 BC025446A0A087WQT1 134 aa25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtco1P00397 514 aa25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pbxip1Q3TVI8 727 aa25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gas7Q60780 421 aa25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DgkeQ9R1C6 564 aa25.7■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Robo3Q9Z2I4 1366 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lrrc32G3XA59 663 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pcdha4O88689 947 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MarcksP26645 309 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LyarQ08288 388 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc15Q8C9M2 810 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt34Q9D646 392 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myo1hQ9D6A1 958 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Trpm5Q9JJH7 1158 aa25.69■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcf2lQ64096 1149 aa25.68■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa25.68■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt9Q6RHW0 743 aa25.68■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Me3Q8BMF3 604 aa25.68■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cep57l1Q8VDS7 400 aa25.68■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 LctF8VPT3 1931 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbkbp1A2A9T0 611 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hoxc8P09025 242 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif3j1Q3UGC7 261 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zcchc14Q8VIG0 956 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tas1r3Q925D8 858 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ZwintQ9CQU5 252 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smc3Q9CW03 1217 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IydQ9DCX8 285 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo16Q9QZM9 334 aa25.67■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01644 108 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01645 108 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01646 108 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 P01647 108 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gp6P0C191 313 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Il2rbP16297 539 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Lmntd2Q0VET5 664 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Icam5Q60625 917 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 N4bp3Q8C7U1 537 aa25.66■■□□□ 1.7
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mettl5Q8K1A0 209 aa25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 33.8 ms