RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	CENPP	Q6IPU0	288 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TTI2	Q6NXR4	508 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC174	Q6PII3	467 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GPBP1	Q86WP2	473 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ACER1	Q8TDN7	264 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF592	Q92610	1267 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	VPS16	Q9H269	839 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MYMK	A6NI61	221 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	C19orf81	C9J6K1	198 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GAS7	O60861	476 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PBX1	P40424	430 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PTGER2	P43116	358 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	STK4	Q13043	487 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CEP55	Q53EZ4	464 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DYM	Q7RTS9	669 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	LDHD	Q86WU2	507 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GPC2	Q8N158	579 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MB21D1	Q8N884	522 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TC2N	Q8N9U0	490 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CEP63	Q96MT8	703 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MED15	Q96RN5	788 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RIT2	Q99578	217 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	WDR18	Q9BV38	432 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	INTS13	Q9NVM9	706 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HACL1	Q9UJ83	578 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1W2PQJ5	194 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MSH4	O15457	936 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FLOT1	O75955	427 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	EYA4	O95677	639 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SLURP2	P0DP57	97 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	BCR	P11274	1271 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	LMNB1	P20700	586 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CASP14	P31944	242 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	EPS15	P42566	896 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HSD17B4	P51659	736 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PRELP	P51888	382 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	OAZ1	P54368	228 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TUBB4B	P68371	445 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	JAG1	P78504	1218 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	GHRHR	Q02643	423 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RBL2	Q08999	1139 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	COASY	Q13057	564 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP2R5C	Q13362	524 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TUBB2A	Q13885	445 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	MAN2A1	Q16706	1144 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FIGN	Q5HY92	759 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SLC5A5	Q92911	643 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	NACC1	Q96RE7	527 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PNKP-231	ENST00000640501	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93

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