RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NOD1Q9Y239 953 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB11O95342 1321 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-216ENST00000628306 B4DLN1 442 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF28PB7ZC32 967 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-216ENST00000628306 PLA2G5P39877 138 aa27.88■■■□□ 2.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.87■■■□□ 2.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-216ENST00000628306 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 STXBP2Q15833 593 aa27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ6P48051 423 aa27.85■■■□□ 2.05
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF618Q5T7W0 954 aa27.82■■■□□ 2.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 CD320Q9NPF0 282 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF6LQ9Y6J9 622 aa27.82■■■□□ 2.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa27.81■■■□□ 2.04
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CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO11Q86XK2 927 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 RAD9AQ99638 391 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 ALG1Q9BT22 464 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-216ENST00000628306 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.81■■■□□ 2.04
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