RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa10.66□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.66□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 SIPA1L1O43166 1804 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 ECM1Q16610 540 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBE2SQ16763 222 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TTBK2Q6IQ55 1244 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 C2CD5Q86YS7 1000 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 CREG2Q8IUH2 290 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CERS5Q8N5B7 392 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CAGE1Q8TC20 777 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 DCAF4Q8WV16 495 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 MKL1Q969V6 931 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 MMRN2Q9H8L6 949 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 KCNMB3Q9NPA1 279 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 USP40Q9NVE5 1235 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 PANK4Q9NVE7 773 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 CEP72Q9P209 647 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 VPS18Q9P253 973 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 HYOU1Q9Y4L1 999 aa10.65□□□□□ -0.7
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IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP10Q9Y6W6 482 aa10.65□□□□□ -0.7
IGHV3-54-201ENST00000622166 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIF13BQ9NQT8 1826 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 FRMD3A2A2Y4 597 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 LRRC53A6NM62 1247 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 USP17L10C9JJH3 530 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 AKR1B10O60218 316 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 MOCS3O95396 460 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 ACTN2P35609 894 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 PICALMQ13492 652 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC27A3Q5K4L6 730 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 HGSNATQ68CP4 663 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 COG1Q8WTW3 980 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 EEF2KMTQ96G04 330 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CAPZA3Q96KX2 299 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 ALS2CR12Q96Q35 445 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRIQ9BWK5 157 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 PSTPIP2Q9H939 334 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 MLXIPQ9HAP2 919 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 NYAP2Q9P242 653 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 TSKSQ9UJT2 592 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 PCDHA12Q9UN75 941 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 STK24Q9Y6E0 443 aa10.64□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa10.64□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TBX3O15119 743 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF185O15231 689 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 NOL4O94818 638 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLSTN1O94985 981 aa10.63□□□□□ -0.71
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IGHV3-54-201ENST00000622166 PLA2G4BP0C869 781 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYP11B2P19099 503 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 TNFRSF8P28908 595 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 MMP14P50281 582 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 GYS2P54840 703 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 AP3B2Q13367 1082 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 EDRF1Q3B7T1 1238 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CCDC40Q4G0X9 1142 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 SFMBT2Q5VUG0 894 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLIS3Q8NEA6 775 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRYGNQ8WXF5 182 aa10.63□□□□□ -0.71
IGHV3-54-201ENST00000622166 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
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