RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALG1Q9BT22 464 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 INCENPQ9NQS7 918 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFAP54Q96N23 3096 aa20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC3-209ENST00000616395 GH1P01241 217 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXO11Q86XK2 927 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM192Q8IY95 271 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 YME1L1Q96TA2 773 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 B4DLN1 442 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 MBTPS2O43462 519 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PSEN2P49810 448 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TCF15Q12870 199 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 NAPBQ9H115 298 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 GFRA3O60609 400 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 DGKDQ16760 1214 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TTC22Q5TAA0 569 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 EMSYQ7Z589 1322 aa20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM221A6NGB7 291 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 M0R296 226 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCK2O43639 380 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 UPP2O95045 317 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 NOVP48745 357 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDE1AP54750 535 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 MFSD10Q14728 455 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 KIAA0753Q2KHM9 967 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRRX2Q99811 253 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 FSD1Q9BTV5 496 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TECTAO75443 2155 aa20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 STXBP3O00186 592 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 HAS3O00219 553 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC45O75419 566 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF286BP0CG31 522 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 HYAL1Q12794 435 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIC1Q14526 733 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRIM67Q6ZTA4 783 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 TOP1MTQ969P6 601 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 RSPH10B2B2RC85 870 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 F2P00734 622 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 RSPH10BP0C881 870 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 THPOP40225 353 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 PNMA2Q9UL42 364 aa20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 MICAL3Q7RTP6 2002 aa20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL4A6Q14031 1691 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXK2Q01167 660 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 PKN1Q16512 942 aa20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBX10O75333 385 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 CTNNB1P35222 781 aa20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.873e-41■■■■■ 39
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 GRM6O15303 877 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 LINC01565O15544 149 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 USH1GQ495M9 461 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 SERINC5Q86VE9 423 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBXL6Q8N531 539 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 SEPT8Q92599 483 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 OSBPL7Q9BZF2 842 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGFLR1Q9H665 355 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD207Q9UJ71 328 aa20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 FOXP2O15409 715 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGS22Q8NE09 1264 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPTC7Q8NI37 304 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBC1D5Q92609 795 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 COL20A1Q9P218 1284 aa20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 NLRC5Q86WI3 1866 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 CSPG5O95196 566 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDHBP11177 359 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZXDAP98168 799 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAMC2Q13753 1193 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 STXBP2Q15833 593 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 FIBCD1Q8N539 461 aa20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC3-209ENST00000616395 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
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