RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613560.1

AC008567.3-201, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene AC008567.3, Length 595 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008567.3-201ENST00000613560 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.54■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 CXCL10P02778 98 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 GHRHRQ02643 423 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 HIC1Q14526 733 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 IL31RAQ8NI17 732 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 ZBTB5O15062 677 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 LPXNO60711 386 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 PTK7Q13308 1070 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 AAK1Q2M2I8 961 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 HOMER1Q86YM7 354 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 ZBED2Q9BTP6 218 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 XIRP2A4UGR9 3374 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008567.3-201ENST00000613560 MYH7BA7E2Y1 1941 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SP2Q02086 613 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PGM5Q15124 567 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SPATA33Q96N06 139 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 NCOR1O75376 2440 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GGPS1O95749 300 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 MBTPS1Q14703 1052 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GDPD5Q8WTR4 605 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PIGSQ96S52 555 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SENP2Q9HC62 589 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 TRANK1O15050 2925 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PPFIA4O75335 1185 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 FCHSD1Q86WN1 690 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GJB5O95377 273 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 POLR2MP0CAP2 368 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PDE4AP27815 886 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 IKBKEQ14164 716 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 GRM4Q14833 912 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 KCNV1Q6PIU1 500 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 RAD9AQ99638 391 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 C16orf70Q9BSU1 422 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 COG5Q9UP83 839 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 TAF6LQ9Y6J9 622 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 CYTH3O43739 400 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 CCND2P30279 289 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 PTH1RQ03431 593 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 TRDNQ13061 729 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 HLA-CQ95604 372 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 LINC01553A4QN01 128 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 LGR5O75473 907 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 CYP21A2P08686 494 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 TGFB3P10600 412 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SERINC5Q86VE9 423 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 MLXIPQ9HAP2 919 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008567.3-201ENST00000613560 EFCAB14O75071 495 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 THPOP40225 353 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 TTC22Q5TAA0 569 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 DBF4BQ8NFT6 615 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 PIBF1Q8WXW3 757 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 NEFLP07196 543 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 ERVK-21P61565 698 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 TROAPQ12815 778 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 ERICH2A1L162 156 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 RSPH10B2B2RC85 870 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 H3BRB1 525 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 LGALS2P05162 132 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 RSPH10BP0C881 870 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 TRAF1Q13077 416 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 WTAPQ15007 396 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008567.3-201ENST00000613560 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms