RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591964.5

PQLC1-213, Transcript of PQ loop repeat containing 1, human

TSL 3

Gene PQLC1, Length 856 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PQLC1-213	ENST00000591964	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	MEIS2	O14770	477 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	PPFIA4	O75335	1185 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	PFKM	P08237	780 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF286B	P0CG31	522 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	C7orf31	Q8N865	590 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	TIFA	Q96CG3	184 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	PBX4	Q9BYU1	374 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	F2	P00734	622 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	RFC2	P35250	354 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	MFSD10	Q14728	455 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	APOA5	Q6Q788	366 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	VWCE	Q96DN2	955 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	ALG1	Q9BT22	464 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	GBF1	Q92538	1859 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PQLC1-213	ENST00000591964	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	IQCF3	P0C7M6	154 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	PBX2	P40425	430 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	MYLIP	Q8WY64	445 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	HAS3	O00219	553 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ICAM3	P32942	547 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ZNF576	Q9H609	170 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	CAGE1	Q8TC20	777 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	MSRA	Q9UJ68	235 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ZBBX	A8MT70	800 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ZBTB43	O43298	467 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	FIBP	O43427	364 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	NEDD9	Q14511	834 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	RAB30	Q15771	203 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	EYS	Q5T1H1	3165 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	ACTN1	P12814	892 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	GRIN2C	Q14957	1233 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	RTN1	Q16799	776 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	FOSL2	P15408	326 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	SEMA3F	Q13275	785 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	METTL7B	Q6UX53	244 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	29.21	■■■□□ 2.27	3e-6	■■□□□ 11.4
PQLC1-213	ENST00000591964	TET1	Q8NFU7	2136 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		29.2	■■■□□ 2.27
PQLC1-213	ENST00000591964	FGD1	P98174	961 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	NLRX1	Q86UT6	975 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	MYO9B	Q13459	2157 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	SELP	P16109	830 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	UBE2S	Q16763	222 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	KCNB2	Q92953	911 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964		A0A0C4DFX4	3053 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964		H3BRB1	525 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	LGALS2	P05162	132 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	NEFL	P07196	543 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	RBL2	Q08999	1139 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	PTK7	Q13308	1070 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	CKB	P12277	381 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	HSPA4	P34932	840 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	RABGGTB	P53611	331 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	FUT2	Q10981	343 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PQLC1-213	ENST00000591964	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms