RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 COG5Q9UP83 839 aa29.85■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 HIC1Q14526 733 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC23AQ15436 765 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPD5Q8WTR4 605 aa29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 KLRF2D3W0D1 207 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MBTPS1Q14703 1052 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF618Q5T7W0 954 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 CYB5R4Q7L1T6 521 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 IL31RAQ8NI17 732 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 MAD2L2Q9UI95 211 aa29.83■■■□□ 2.37
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB5O15062 677 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB5O95377 273 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MYSM1Q5VVJ2 828 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 STOX1Q6ZVD7 989 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-CQ95604 372 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.82■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PGM5Q15124 567 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA33Q96N06 139 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MTUS1Q9ULD2 1270 aa29.81■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GGPS1O95749 300 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SP2Q02086 613 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIG10LQ86VR7 867 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD9AQ99638 391 aa29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PPFIA4O75335 1185 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 IKBKEQ14164 716 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 HOMER1Q86YM7 354 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 SUGCTQ9HAC7 445 aa29.79■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC01553A4QN01 128 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM117BQ6P1L5 589 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNV1Q6PIU1 500 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf70Q9BSU1 422 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH6P13533 1939 aa29.78■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 EFCAB14O75071 495 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LGR5O75473 907 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 ERVK-21P61565 698 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 PIGSQ96S52 555 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 LMCD1Q9NZU5 365 aa29.77■■■□□ 2.36
CAPNS1-211ENST00000590874 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SERINC5Q86VE9 423 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EXOC6Q8TAG9 804 aa29.76■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 BDP1A6H8Y1 2624 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CCND2P30279 289 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GRM4Q14833 912 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 FCHSD1Q86WN1 690 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 BCAS3Q9H6U6 928 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SENP2Q9HC62 589 aa29.75■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTH3O43739 400 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 POLR2MP0CAP2 368 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TGFB3P10600 412 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 THPOP40225 353 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 DBF4BQ8NFT6 615 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHX3Q9H6B9 360 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MLXIPQ9HAP2 919 aa29.74■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 EMSYQ7Z589 1322 aa29.73■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 NCOR1O75376 2440 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH10B2B2RC85 870 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 RSPH10BP0C881 870 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXC8P31273 242 aa29.72■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf102A2RUQ5 167 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BRB1 525 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 LGALS2P05162 132 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TRDNQ13061 729 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0A1Q93050 837 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 C17orf80Q9BSJ5 609 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 INSL6Q9Y581 213 aa29.71■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 AMHP03971 560 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP21A2P08686 494 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 OSBPL7Q9BZF2 842 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.7■■■□□ 2.35
CAPNS1-211ENST00000590874 MYH7BA7E2Y1 1941 aa29.7■■■□□ 2.34
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