RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589497.5

GIPC1-210, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 853 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-210ENST00000589497 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
GIPC1-210ENST00000589497 NID2Q14112 1375 aa21.64■■□□□ 1.06
GIPC1-210ENST00000589497 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA0355O15063 1070 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 GNA11P29992 359 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PPTC7Q8NI37 304 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CDHR1Q96JP9 859 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.64■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SEC24BO95487 1268 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ICAM3P32942 547 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NBPF20Q3BBV1 942 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CCDC148Q8NFR7 591 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PRO3102Q9H379 93 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NOD1Q9Y239 953 aa21.63■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 GRIN2DO15399 1336 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PPFIA4O75335 1185 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CDKL5O76039 1030 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TIMP1P01033 207 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF76P36508 570 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NEK4P51957 841 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SP2Q02086 613 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 AP3B2Q13367 1082 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NTRK3Q16288 839 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MCTP2Q6DN12 878 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TDHQ8IZJ6 230 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 BICD2Q8TD16 824 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TRPV6Q9H1D0 765 aa21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 DNAH12Q6ZR08 3092 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CEP290O15078 2479 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MTMR1Q13613 665 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PKN1Q16512 942 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NFRKBQ6P4R8 1299 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CYFIP1Q7L576 1253 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 GPRASP2Q96D09 838 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PGBD1Q96JS3 809 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ANO3Q9BYT9 981 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM260Q9NX78 707 aa21.61■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MAFGO15525 162 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 B4GALT4O60513 344 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 CD4P01730 458 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 AK2P54819 239 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 NLRP5P59047 1200 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 FPGSQ05932 587 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 HSDL1Q3SXM5 330 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TMEM199Q8N511 208 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 C7orf31Q8N865 590 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ALG1Q9BT22 464 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TBX21Q9UL17 535 aa21.6■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ESYT2A0FGR8 921 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 DEXIO95424 95 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SP4Q02446 784 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 METTL7BQ6UX53 244 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SENP7Q9BQF6 1050 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 HIPK3Q9H422 1215 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 JADE2Q9NQC1 790 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 TPCN1Q9ULQ1 816 aa21.59■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ITGB5P18084 799 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 ITGB8P26012 769 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PSEN2P49810 448 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MFSD10Q14728 455 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MFSD5Q6N075 450 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.58■■□□□ 1.05
GIPC1-210ENST00000589497 PFKFB2O60825 505 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 ZNF286BP0CG31 522 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 XBP1P17861 261 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SCRN1Q12765 414 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 C8orf34Q49A92 452 aa21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CYP2C18P33260 490 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 ARHGAP4P98171 946 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 SEMA3FQ13275 785 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.041e-6■■■■□ 21
GIPC1-210ENST00000589497 PTGISQ16647 500 aa21.56■■□□□ 1.04
GIPC1-210ENST00000589497 KIAA0753Q2KHM9 967 aa21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.4 ms