RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 STXBP3O00186 592 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 HOXC6P09630 235 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 GRB14Q14449 540 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PAGE5Q96GU1 130 aa28.65■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 ZMYND12Q9H0C1 365 aa28.65■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 STX8Q9UNK0 236 aa28.65■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 UBASH3AP57075 661 aa28.64■■■□□ 2.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.64■■■□□ 2.18
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CAPNS1-204ENST00000587718 KLRF2D3W0D1 207 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 IGHA2P01877 340 aa28.63■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GNA11P29992 359 aa28.63■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 DHX58Q96C10 678 aa28.63■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 MYL1P05976 194 aa28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 MB21D1Q8N884 522 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 EPSTI1Q96J88 318 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATC1LQ9H0A9 340 aa28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 CYTH3O43739 400 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.62■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 VSTM4Q8IW00 320 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 SHCBP1Q8NEM2 672 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 MAP7D2Q96T17 732 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CEP290O15078 2479 aa28.62■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATG4CQ96DT6 458 aa28.61■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 C6orf50Q9HD87 102 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.61■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ISM2Q6H9L7 571 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PDILTQ8N807 584 aa28.6■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RIOX1Q9H6W3 641 aa28.6■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 A0A087X0B3 334 aa28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 STRNO43815 780 aa28.59■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ERCC3P19447 782 aa28.59■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 ATP2B2Q01814 1243 aa28.58■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 CCSER1Q9C0I3 900 aa28.58■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
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CAPNS1-204ENST00000587718 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PDXDC2PQ6P474 469 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 CHRDL2Q6WN34 429 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RRP9O43818 475 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-204ENST00000587718 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP28.57■■■□□ 2.16
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