RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	INF2	Q27J81	1249 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	IFFO2	Q5TF58	517 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	GPRASP2	Q96D09	838 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	UBIAD1	Q9Y5Z9	338 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS4	O75173	837 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	GJA9	P57773	515 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CEP55	Q53EZ4	464 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CDHR1	Q96JP9	859 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	JADE2	Q9NQC1	790 aa		28.38	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	DNM1L	O00429	736 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	GGPS1	O95749	300 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CAPN2	P17655	700 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229		Q9Y3F1	56 aa		28.37	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CYP3A4	P08684	503 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	TGFB3	P10600	412 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	ICAM3	P32942	547 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SEMA3F	Q13275	785 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	MCTP1	Q6DN14	999 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FAM205C	A6NFA0	338 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FAM86B1	E9PN63	330 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CPT1A	P50416	773 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SP4	Q02446	784 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	LETM2	Q2VYF4	491 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	PRR16	Q569H4	304 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	UIMC1	Q96RL1	719 aa		28.35	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	ZEB2	O60315	1214 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SP2	Q02086	613 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	NEDD9	Q14511	834 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	KCNA10	Q16322	511 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	NECAB2	Q7Z6G3	386 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	NEK8	Q86SG6	692 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	FERMT2	Q96AC1	680 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	MYL3	P08590	195 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	AR	P10275	920 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	USP11	P51784	963 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	LAMC2	Q13753	1193 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	AFG1L	Q8WV93	481 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	TNFRSF25	Q93038	417 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SPATA33	Q96N06	139 aa		28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	28.33	■■■□□ 2.13
GPS1-223	ENST00000584229	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	TDP2	O95551	362 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	28.32	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MEIS1	O00470	390 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MAFG	O15525	162 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ATP9A	O75110	1047 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ASGR1	P07306	291 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ATP2B1	P20020	1258 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	SDF4	Q9BRK5	362 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ALPK3	Q96L96	1907 aa		28.31	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CTAGE5	O15320	804 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MMP3	P08254	477 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	KCNA2	P16389	499 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	PDC	P20941	246 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	CIITA	P33076	1130 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	ACLY	P53396	1101 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	BECN1	Q14457	450 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		28.3	■■■□□ 2.12
GPS1-223	ENST00000584229	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	28.3	■■■□□ 2.12

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