RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573989.1

TRAPPC1-206, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC1, Length 436 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-206ENST00000573989 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 C8orf76Q96K31 380 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 MLXIPQ9HAP2 919 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 KPNA6O60684 536 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 ARIH2O95376 493 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 USP11P51784 963 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 GLT1D1Q96MS3 346 aa14.54□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.54□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 GGPS1O95749 300 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 MMP1P03956 469 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 ASGR1P07306 291 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 COL6A1P12109 1028 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 KRT40Q6A162 431 aa14.53□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 STARD7Q9NQZ5 370 aa14.53□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.52□□□□□ -0.08
TRAPPC1-206ENST00000573989 ELP1O95163 1332 aa14.52□□□□□ -0.08
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TRAPPC1-206ENST00000573989 A0A1W2PQY0 241 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC1-206ENST00000573989 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.52□□□□□ -0.09
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TRAPPC1-206ENST00000573989 NEK8Q86SG6 692 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.5□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 NFASCO94856 1347 aa14.49□□□□□ -0.09
TRAPPC1-206ENST00000573989 BTBD18B2RXH4 712 aa14.49□□□□□ -0.09
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